نشانگر زیستی سرطان معده

تلاش های بسیاری در سال های اخیر برای یافتن پروتئین های موثر در سرطان معده انجام شده است. دانشمندان با استفاده از فهرست جامعی از پروتئین های دخیل در سرطان معده توانستند اطلاعاتی را بدست آورند. مطالعه شبکه های برهم کنش پروتئین- پروتئین از طریق سیستم ها تجزیه و تحلیل مبتنی بر زیست شناسی، راهکارهای مناسبی را برای کشف پروتئین های کاندید و مسیرهای بیولوژیکی کلیدی فراهم می کند. در این مطالعه، ما مضامین عملکردی غالب و پارامترهای مرکزیت از جمله میان قرار گرفتن را مورد بررسی قرار دادیم. همچنین درجه هریک از خوشه های توپولوژیکی و زیر شبکه های فعال به صورت بیانی در شبکه حاصل بررسی شد. نتایج تجزیه و تحلیل عملکردی بر روی مجموعه ژن ها نشان داد که مسیر سیگنال دهی نوروتروفین، چرخه سلولی و دفع نوکلئوتیدی دارای قوی ترین سیگنال های غنی سازی است. با توجه به پارامترهای مرکزیت محاسبه، TAF۱، HNF۴A و TP۵۳ به عنوان مهم ترین گره ها در شبکه تعامل درگیر نشان داده می شوند.