شناسایی ژن های کلیدی و مسیرهای بیولوژیکی مرتبط با کم باروری در گاو (Bos Taurus): یک مطالعه بیوانفورماتیک
سال انتشار: 1403
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 27
فایل این مقاله در 9 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_VTJ-37-1_007
تاریخ نمایه سازی: 27 فروردین 1403
چکیده مقاله:
کم باروری یک موضوع مهم در صنعت گاوهای شیری است که می تواند اقتصاد یک مزرعه را تحت الشعاع قرار دهد. بنابراین، بررسی پدیده های بیولوژیکی که می تواند منجر به کم باروری شود، بسیار مهم است. مطالعه حاضر برای شناسایی ژن های و مسیرهای بیولوژیکی مرتبط با کم باروری طراحی شده است. به همین منظور، پروفایل بیان ژن آندومتر شامل ۶ نمونه بارور و ۵ نمونه نابارور گاو) (Bos Taurus از پایگاه داده GEO جمع آوری شد. ژن های با بیان افتراقی نمونه ها توسط نرم افزار آنلاین GEO۲R غربالگری شدند. تجزیه و تحلیل برهمکنش پروتئین-پروتئین، تجزیه و تحلیل ماژول، تجزیه و تحلیل آنتولوژی ژن، تجزیه و تحلیل مسیرهای بیولوژیک و شناسایی ژن های کلیدی با بیان بیان افتراقی توسط نرم افزارهای با ارجاع دهی بالا انجام شد. بر اساس نتایج مقایسه نمونه های بارور و نابارور، ۱۶۹ ژن به عنوان ژن های با بیان افتراقی معرفی شدند که به ترتیب حاوی ۵۳ و ۱۱۶ ژن با بیان بالا و پایین بودند. علاوه بر این، نتایج تجزیه و تحلیل ماژول وجود چهار خوشه را تایید کرد که امتیاز آنها بین ۸/۲ و ۳ بود. نتایج تجزیه و تحلیل غنی سازی آنتولوژی ژن نشان داد که ترشح انتقال دهنده های عصبی، فضای خارج سلولی، فعالیت استروئید دهیدروژناز، چرخه وزیکول سیناپسی به ترتیب معنادارترین فرآیند بیولوژیکی، محفظه سلولی، عملکرد مولکولی و مسیر KEGG، بودند. نتایج نشان داد که ۵ ژن شامل SYT۱، ITGAM، HABP۲، CHGA و TAT، ژن های کلیدی مرتبط با کم باروی هستند که می توانند به عنوان نشانگرهای مولکولی مناسب در برنامه های اصلاحی و مدیرت تولید مثل گاوداری ها معرفی شوند.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
علی فروهرمهر
۳. گروه علوم دام، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم آباد، ایران
سید مجتبی موسوی
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم آباد، ایران
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
