استفاده از دادههای بیان ژن در تعیین شبکه ی برهمکنش ژنهای کاهش بیان یافته موثر برصفت باروری گاو شیری

سال انتشار: 1402
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 20

فایل این مقاله در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

ICSDA07_410

تاریخ نمایه سازی: 10 اردیبهشت 1403

چکیده مقاله:

صنعت دامداری گاو شیری یکی از حوزههای بسیار مهم اقتصادی در جهان است . سودآوری این صنعت مستقیما به عملکرد تولیدمثلی گاوها وابسته است . بیوانفورماتیک به عنوان یک حوزه ژنومیک در علوم زیستی اهمیت بسیاری دارد و در تحلیل و تفسیر اطلاعات ژنومیک نقش کلیدی ایفا می کند. در زمینه دامپروری و به خصوص دامهای شیری ، بیوانفورماتیک می تواند به مطالعه ساختار و عملکرد ژنوم و پروتئین ها کمک کند. این برنامه ها و روشها از زیرساخت های محاسباتی برای تحلیل دادههای بزرگ ژنومی استفاده می کنند. با توجه به اهمیت باروری در دامپروری ، پژوهش هایی در زمینه دادههای بیان ژن و ژنهای کاهش بیان یافته موثر برصفت باروری گاو شیری در رابطه با این موضوع انجام می شود تا بتوان بهبودهایی در عملکرد باروری دامها داشت . این پژوهش با هدف بررسی تاثیر شبکه های برهم کنش ژنهای کاهش بیان یافته موثر برصفت باروری گاو شیری با استفاده از دادههای بیان ژنی انجام شده است که در آن ابتدا ژنهای مرتبط با باروری در گاو، از پایگاه اطلاعاتی NCBI استخراج شد، سپس توسط R۲GEO و با استفاده از نرم افزار R نتایج ، تجزیه وتحلیل گردید و درمرحله بعدی ، شبکه ی میان ژنی ،توسط پایگاه اطلاعاتی String ایجاد گردید و همچنین از پایگاه DAVID برای مطالعه ی بیولوژیکی ژنها، استفاده شد. یافته ها تحقیق حاضر نشان داد ژنهای به دست آمده ازجمله ۱H۳ZFC ,۴MRTO ,۵۳CD ,۱A, SPI۲BCL و ۷NIP به وسیله مسیرهای بیولوژیکی در فرآیند باروری دخیل هستند و این ژنها ممکن است نقش های مختلفی در بیولوژی باروری دامها ایفا کنند. از یافته های این پژوهش ، می توان در مطالعات پویش ژنوم (GWAS) در امر ارزیابی ژنتیکی گاوهای شیری استفاده نمود

کلیدواژه ها:

نویسندگان

سیدهمایون فرهنگ فر

استاد، بخش علوم دام، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بیرجند

مهدی ضیاء

دانشآموخته کارشناسیارشد، بخش علوم دام، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بیرجند

الهام بهدانی

دکتری، دارای مجوز همکاری با دانشکده کشاورزی، دانشگاه بیرجند

محمدباقر منتظرتربتی

استادیار، بخش علوم دام، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بیرجند

معصومه جهانی

دانشجوی کارشناسی، بخش علوم دام، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بیرجند