مطالعه تنوع فیلوژنتیکی ژن LR10 در گونه های مختلف گندم با استفاده از تکنیک Insilco AFLP Analysis

در این بررسی از 6 توالی ژن LR10 در گونههای مختلف گندم که از پایگاه اطلاعات ژنتیکی NCBI استخراج شده بود، استفاده گردید. با استفاده از نرمافزار آنلاین webcuter آنزیمهای برشی که دارای بیشترین سایت برشی در گونههای مورد نظر بودند انتخاب شدند. این آنزیمها عبارتند از ،EcoRI ،HindIII BamHI در مرحله بعد نرمافزار CLC Workbench به توالیها اعمال شد، نتایج حاصل توسط این نرمافزار به صورت شبیه ساز بر روی ژل برده شد. در مرحله بعد با توجه به وجود یا عدم وجود باند به نمونهها اعداد 1 و 0 داده شد و در برنامه Excel ذخیره گردید. در ادامه با استفاده از Darwin ماتریسهای عدم تشابه براساس الگوریتمهای دایس و جاکارد بهدست آمد. با استفاده از نرم افزار Mega درخت فیلوژنتیکی ترسیم و تفسیر شد. نتایج بدست آمده از این بررسی نشان داد که گونه های مختلف گندم از لحاظ ژن LR10 در 3 دسته تقسیم بندی می شوند.