مقایسه بیوانفورماتیکی ژن hrpN مولد هارپین در چند گونه اروینیای واقعی و پکتولیتیک
سال انتشار: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 749
متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
AGRIBIOTECH03_063
تاریخ نمایه سازی: 27 تیر 1392
چکیده مقاله:
هارپین، پروتئین مقاوم به حرارت، اسیدی، غنی از گلایسین و فاقد سیستئین می باشد که توسط تیپ ترشحی III در چندین جنس گرم منفی باکتریایی ترشح می شود. این مولکول به عنوان الیسیتور واکنش فوق حساسیت در گیاه غیر میزبان و نیز توسعه دهنده بیماری در گیاه میزبان مطرح است. توالی نوکلئوتیدی و اسید آمینه ژن hrpN مولد هارپین متعلق به 5 گونه باکتری گرم منفی از گروه اروینیاهای واقعی و پکتولیتیک از بانک اطلاعاتی ژن، بازیابی و تفاوت در سطح ژن و پروتئین مورد ارزیابی قرار گرفت. تنوع در طول توالی نوکلئوتیدی و ترتیب قرار گرفتن نوکلئوتیدها در بین گونه های اروینیای واقعی در مقایسه با اروینیاهای پکتولیتیک بیشتر بود. در درخت فیلوژنتیک ترسیمی، این ژن امکان تفکیک بین گونه های جنس Erwinia و دو جنس پکتولیتیک Dickeya و Pectobacterium را مهیا نموده است.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
غزاله طاقدره
دانشجوی فوق لیسانس گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی
ساره بقائی راوری
استادیار گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :