مطالعه فیلوژنتیکی ژنهای مقاوم به بیماری و مطالعه عملکردی ژن RLM1 در Arabidopsis thaliana با ابزارهای بیوانفورماتیکی
محل انتشار: دوازدهمین کنگره ژنتیک ایران
سال انتشار: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 1,282
فایل این مقاله در 7 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
CIGS12_0170
تاریخ نمایه سازی: 5 بهمن 1392
چکیده مقاله:
با وجود پیشرفتهای چشمگیر در استراتژی های کنترل بیماریهای گیاهی، اما همچنان تعداد زیادی از پاتوژنها و آفات خسارت زیادی وارد می کنند. با مقایسه توالیهای اسید آمینه های پروتئینهای رمز شده توسط ژنهای مقاومت در گیاهان با منشاء تکاملی مختلف مشخص شده است که ژنهای مقاومت بر اساس مشابهتهای ساختاری تولیدت پروتئین به گروه های CC-NBS-LRR-LRR, TIR-NBS-LRR خارج سلولی LRR kinase و گیرنده کینازی طبقه بندی می شوند. در این تحقیق با بررسی توالی پروتئینی ژنهای مقاومت در گیاهان مختلف، روابط تکاملی و نحوه ارتباط آنها با نرم افزارهای بیوانفورماتیکی تعیین شد. نتایج تجزیه کلاستر مشخص نمود توالی پروتئینی این ژنها در سه گروه قرار دارند گیاه آرابید و پسیس که دارای ژن مقاومت Rlm1 در گروه جداگانه ای قرار دارد. نتایج ماتریس تکاملی نشان داد که بیشترین فاصله (0/99) بین گیاه Populus trichocarpa و Solanum lycopersicum کمترین فاصله (0/287) بین Solanum lycopersicum و Vitis vinifera می باشد. نتایج همردیفی پروتئین های مشخص نمود که ژنهای مقاومت از هم دور هستند و از یک منشاء مشابه نیستند. نتایج عملکردی Rlm1 در گیاه آرابیدوپسیس نشان داد که این ژن بر روی کروموزوم 1 قرار دارد و با متحد شدن با سیگنالهای داخل سلولی یا خارج سلولی در انتقال سیگنالها از یک قسمت غشا به قسمت دیگر فعالیت می کند.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
مهسا محمدجانیاسرمی
دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
پرویز حیدری
دانشجوی کترای اصلاح نباتات دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
حمید نجفی زرینی
استادیار اصلاح نباتات دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :