تجزیه فیلوژنی ژن کاندیدای تحمل به تنش شوری، HvCBL4 در اکوتیپهای جو (Hordeum sp.)

مطالعه حاضر برای طبقهبندی فیلوژنی ژن کاندیدای تحمل به تنش شوری، HvCBL4 در 62 اکوتیپ جو انجام گرفته است. توالی نوکلئوتیدی این ژن به هفت کانتیگ تقسیم گردید. برای هر کانتیگ یک درخت فیلوژنی تهیه گردید. طبقه بندیژنوتیپها بر اساس میزان همولوژی ژن در کانتیگهای مختلف بوده است. اثرات تجمعی همه موتاسیونهای نوکلئوتیدی بر فیلوژنی یک ژنوتیپ ارزیابی گردید. نتایج نشان داد، ژنوتیپهایی که در گروههای مشابه قرار گرفتند همولوژی و قرابت ژنتیکیبالایی نسبت به یکدیگر داشتند. در برخی موارد، ژنوتیپهای متعلق به مناطق مختلف )جغرافیایی( در یک گروه مشترک قرارگرفتند. این بدین معنی است که گروهبندی آنها مستقیماً تحت تأثیر منشأ ژنتیکی آنها میباشد. ما همچنین دریافتیم که مناطق اگزونی و اینترونی نرخ موتاسیون و میزان همولوژی در کانتیگها را تحت تأثیر قرار دادند. زیرا در کانتیگهای مختلفیک ژنوتیپ مقادیر متعددی از همولوژی وجود داشت. ما میتوانیم تأثیر موتاسیونها روی ساختار و عملکرد ژن را نیز بررسی نمائیم. نوع و محل وقوع موتاسیون عامل مهمی در این زمینه است. همه موتاسیونهایی که در ژنوتیپها رخ دادند در جهت سازگاری آنها با محیطی بوده که در آن رشد یافته بودند. تغییرات ژنتیکی مشابه و سطح بالای همولوژی در ژنوتیپهای رشد یافته در مناطق مختلف متأثر از شوری، که در مواجه با شرایط مشابه اقلیمی قرار گرفتند، این امر را توجیه می کند