بررسی بیوانفورماتیکی پروتئین فارنسیل دیفسفات سنتاز در خانواده استراسه و چند خانواده گیاهی دیگر

آنزیم فارنسیل دیفسفات سنتاز یک آنزیم کلیدی در سنتز ایزوپرنوئیدها می باشد که باعث ایجاد ترکیبات 15 کربنه برای متابولیتهای ضروری از جمله استرول ها دولیکول ها و یوبی کیونین ها می شود. این آنزیم در بسیاری از خانوادههای گیاهی شناسایی شده است. باتوجه به اهمیت بالای این دسته از متابولیتهای ثانویه گیاهی، بررسی و شناخت بیشتر این متابولیتها حائز اهمیت میباشد. هدف از اینتحقیق مطالعه بیوانفورماتیکی توالی پروتیینی مربوط به ژن مزبور میباشد. در این تحقیق ابتدا توالی های پروتئینی آنزیم فارنسیل دیفسفات سنتاز از پایگاه اطلاعاتیNCBIدریافت شد و سپس توالیهای گرفته شده توسط نرم افزار تحت وبClustalWمورد همردیفی قرارگرفت و درخت فیلوژنی آن توسط نرم افزارCLC Main Work Bench6.6.2رسم شد. این نتایج نشان داد که ژن فارنسیل دیفسفات سنتاز در خانوادهAsteraceaeدو گونهA. annua و Artemisia spiciformisو دو گونهTanacetumcoccineum و Achilleaasiatica رابطه فیلوژنی تزدیکی را با یک دیگر دارند. همچنین گونهTanacetumcinerariifoliumاز خانوادهAsteraceaeرابطه فیلوژنی نزدیکی رابا گونهPolygala tenuifoliaاز خانوادهFabaceaeنشان داد. گونهPolygala tenuifolia نیز بیشترین فاصله شاخه نسبت به سایر گونه هانشان داد. همچنین ماتریس فصله برای این توالی های پروتئینی نیز رسم گردید.