بررسی بیوانفورماتیکی میکروRNAهای درگیر در تنشهای غیرزیستی در آرابیدوپسیس

میکروRNAهاRNAهای کوچکی هستند که در تنظیم بیان ژن پس از رونویسی نقش دارند و به عنوان تنظیم کنندههای منفی بیان ژن دریوکاریوتها فعالیت میکنند. میکروRNAها دارای نقش کلیدی در پاسخ به تنشها هستند. هدف از این تحقیق شناسایی میکروRNAهای درگیر در تنشهای غیرزیستی، بررسی عملکرد آنها و همچنین بررسی ناحیه راه انداز 1 آنها است. به این منظور ابتدا شبکه ژنی برای گیاه آرابیدوپسیس، تنشهای خشکی، شوری، سرما و میکروRNAها رسم شد و میکروRNAهای درگیر در تنش شناسایی شد. در مرحله بعدناحیه راه انداز میکروRNAها توسط نرم افزارPlantcare مورد بررسی قرار گرفت. نتایج حاصل از رسم شبکه ژنی بیان داشت که میکروRNAهای 156,،396 ،319 ،171 ،167 ،165 ،159,397 و 398 در تنشهای غیرزیستی نقش دارند. میکرو RNA های171و398و166 به هر سه تنش خشکی شوری و سرما پاسخ دادند. میکروRNAهای 156,،172 ،171 ،169 ،165 ،167 ،159,319 و 396 در رشد وتوسعه گیاهان نقش دارند و با تنظیم بیان ژنهای هدف خود در جهت تضعیف رشد گیاه برای کاهش متابولیسم عمل میکنند. همچنین کاهش میزان رشد در شرایط تنش به واسطه میکروRNAهای درگیر در علامتدهی 2 اکسین (میکرو RNA ی 167 ) و میکروRNA های تنظیمکنندهی عوامل رونویسی مانندMYB و SPL ،SCL ،ARFصورت میگیرد