شناسایی متغیرهای مهم نوکلئوتیدی در توالیهای پاندمیک و غیرپاندمیک ویروس آنفلونزا آ با استفاده از الگوریتم پنجره لغزان و الگوریتمهای آماری وزندهی

سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 622

فایل این مقاله در 6 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

BSCONF01_449

تاریخ نمایه سازی: 15 بهمن 1393

چکیده مقاله:

آنفلونزا بیماری ویروسی حاد دستگاه تنفسی است. مهمترین گونه آن آ است که باعث بروز پاندمی و مرگ و میر گسترده در سطح جهان میشود. از این رو شناسایی و تشخیص متغیرهایی که باعث بروز تغییرات بهخصوص درسطح ژنومی آنفلونزا آ میشوند، بسیار مهم است. در این مطالعه از الگوریتم پنجره لغزان و الگوریتمهای وزندهی به منظور شناسایی متغیرهای مهم نوکلئوتیدی توالیهای پاندمیک و غیر پاندمیک ویروس آنفلونزا آ استفاده شده است. از تحلیل خروجیها، 179 ویژگی مشترک در نتایج حاصل از وزندهی ها شناسایی شده است. ده ویژگیدر بین نتایج الگوریتمهای وزندهی نیز به عنوان 10 ترکیب نوکلئوتیدی برتر شناخته شده است.

نویسندگان

محبوبه فصیحی

دانشجوی کارشناسی ارشد مهندسی فناوری اطلاعات دانشگاه قم

منصور ابراهیمی

عضو هیئت علمی دانشکده علوم پایه دانشگاه قم

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • di BS, K., C. Hoffmann, and W. Preiser, Influenza Report ...
  • Nicholls , H., Pandemic influenza: the inside story. PLoS Biology, ...
  • Nguyen, A.M., Noymer, Andrew, Influenza mortality in the United States, ...
  • Liu, L., Fisher, Brian E, Dowd, Kimberly A, Astemborski, Jacquie, ...
  • immune selection during the transition from acute to chronic infection. ...
  • Proutski, V., Holmes, E., SWAN: sliding window analysis of nucleotide ...
  • Novitsky, V.A., Montano, Monty A, McLane, Mary F, Renjifo, Boris, ...
  • Fares, M.A., Elena, Santiago F., Ortiz, Javier, Moya, Andres., Barrio, ...
  • Paraskevis, D., Deforche, Koen, Lemey, Philippe, Magiorkinis, G, Hatzakis, A, ...
  • De Oliveira, T., Deforche, Koen., Cassol, Sharon., Salminen, Mika., Paraskevis, ...
  • Abecasis, A.B. Lemey, Philippe., Vidal, Nicole., de Oliveira, Tulio., Peeters, ...
  • I11. Kadokura, M., Maekawa, Shinya, Sueki, Ryota, Miura, Mika, Komase, ...
  • Goi, N., Moratorio, Gonzalo., Coppola, Leticia., Ramas, Viviana., Comas, Victoria., ...
  • Chenna, R., et al., Multiple sequence alignment with the Clustal ...
  • Kreuter, B., Layer, Ryan M., McDaniel, Michelle., Robins, Gabriel., Skadron, ...
  • Ebrahimie, E., et al., Protein attributes contribute to halo-stability, bioinformatics ...
  • Ebrahimi, M., et al., Prediction _ thermostability from amino acid ...
  • نمایش کامل مراجع