تشخیص قارچ Fusarium oxysporum f. sp. Lycopersici در گوجه فرنگی با روش LAMP

گیاه گوجه فرنگی مورد حمله عوامل بیماریزای متعددی قرار می گیرد که برخی از آنها باعث وارد آمدن خسارت سنگین اقتصادی می گردند. جدایه Fusarium oxysporum f. sp. Lycopersic بر روی ارقام مختلف گوجه فرنگی سبب پژمردگی آوندی می گردد. پژمردگی ناشی از فوزاریوم در مناطق گرمسیر و خاک های سبک بیشتر متداول می باشد. روش های مختلفی جهت تشخیص این قارچ وجود دارند. LAMP روش جدیدی جهت تشخیص پاتوژن ها می باشد که در آن تمام واکنش ها می تواند تحت شرایط هم دما انجام شود و نیازی به تجهیزات گران قیمت ندارد. در این پژوهش، جهت تشخیص راحتتر و سریعتر این جدایه، بعد از کشت قارچ در محیط کشت PDA، استخراج DNA ژنومی قارچ انجام شد. طراحی آغازگرها برای ژن RNA ریبوزومی 28s صورت گرفت و به دنبال آن برای اولین بار، واکنش LAMP انجام شد. واکنش مثبت با دیدن کدورت حاصله و بردن محصول بروی ژل آگارز مشاهده گردید. از مزایای این روش جدید در مقایسه با سایر روش های قبلی می توان به سهولت، سرعت، سلامتی و هزینه پایین آن اشاره نمود.