تجزیه و تحلیل RNA های کوچک (sRNAs) گندم نان(Triticum aestivum) در پاسخ به آلودگی با قارچ عامل بادزدگی سنبله(Fusarium (graminearum
سال انتشار: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 826
فایل این مقاله در 6 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
NBCI08_0692
تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1394
چکیده مقاله:
توالی یابی RNA یا RNA-Seq روشی است که در سال های اخیر برای نمایه پایی ترانسکریپتوم توسعه یافته است وامکان شناسایی و نمایه یابی RNA های غیر کد کننده کوچک را با دقتی بالا و در تعدادی بسیارزیاد فراهم آورده است. RNAهای غیرکدکننده کوچک از طریق مکانیسم های خاموش کردن ژن طی رونویسی (TGS) یا خاموش کردن ژن پس از رونویسی (PTGS) بیان بسیاری ازژن ها را کنترل می نمایند. در این پژوهش با استفاده از پایگاه های داده ی مربوط به RNA های کوچک و ابزارهای بیوانفورماتیک و با بکارگیری روش های آماری، مقایسه دو کتابخانه RNA های کوچک مربوط به سنبله گندم در شرایط نرمال (731975 توالی) وآلودگی به قارچ فوزاریوم (1429467 توالی) انجام شد. RNA های کوچک با بیان افتراقی بین دو شرایط ، نوع RNA های کوچک (miRNAیا siRNA بودن) و حفظ شده با جدید بودن ان ها شناسایی گردید. ژن های هدف برخی از توالی ها که بیشترین تفریق بیان را نشان داده بودند مشخص شد و شبکه ژنی بین آن ها تعیین گردید. نتایج نشان داد 11446 توالی دارای بیان افتراقی طی آلودگی به قارچ بودند. بررسی ژن های هدف و شبکه ژنی نیزنشان داد که عمده ژن های هدف از دسته عوامل رونویسی و به خصوص عوامل رونویسی اختصاصی گیاهان نظیر Squamosa promoter-binding protein-like (SPL) و Homeodomain-leucine zipper (HD-Zip) بودند.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
روح الله شاملو دشت پاگردی
دانشجوی دکتری اصلاح نباتات، بخش زراعت و اصلاح نباتات دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز
هومن راضی
استادیار بخش زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز
اسماعیل ابراهیمی
استادیار بخش زراعت و اصلاح نباتات دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :