شناسایی جهشو آنالیز هاپلوتیپی ژن HSP27 در دامهای اهلی

پروتئین های شوک گرمایی به علت ارتباط با صفات مهم اقتصادی در دام ها از قبیل مقاومت به تنش گرمایی ،ورم پستان و تولید شیر دارای اهمیت خاصی است. در تحقیق حاضر توالی ژن های خانوادهHSP27 از بانک اطلاعاتیNCBI استخراج گردید. با استفاده از روش حداکثردرستنمایی درصد جایگزینی نوکلئوتیدها محاسبه و درخت فیلوژنی به روش NEIGHBOR JOINING ترسیم شد نتایج مطالعات بیوانفورماتیک 22 توالی از ژنHSP27 منجر به ایجاد 10 هاپلوتیپ با تنوع هاپلوتیپی 0,91342 در گونه های مورد مطالعه شد. میانگین تعداد تفاوت های نوکلئوتیدیk= 26.26840و تنوع نوکلئوتیدی pi=0.06674بود. به طور کلی در میان 22 توالی مورد بررسی، 83 جهش یافت شد. با توجه به آنالیزهای تنوع هاپلوتیپی، تنوع نوکلئوتیدی و درخت فیلوژنتیکی می توان گفت تنوع ژنتیکی اسب نسبت به سایر حیوانات بیشتر است. بررسی ژن های این خانواده نشان داد که جمعیت بز و گاو اجداد مشترک نزدیک هم دارند همچنین گاو و خوک تفاوت زیادی باهم داشتند. باتوجه به نقش مهم این ژن در چرخه تولید نتایج این تحقیق می تواند به عنوان یک پایه اطلاعات مولکولی مولکولی برای مطالعات بعدی مورد استفاده قرار گیرد