روشی نوین برای پیش بینی و ارزیابی miRNA
سال انتشار: 1395
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 549
فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
AISST02_027
تاریخ نمایه سازی: 6 اردیبهشت 1396
چکیده مقاله:
شناسایی MicroRNA) miRNA ها) و ژنهای هدف آنها نقش مهمی را در درک فعالیت های نظارتی در سلول ایفا میکند. اکثر روش های محاسباتی بر توالی تکمیلی بین miRNA ها و ژنهای هدف بدون استفاده از داده های بیانشده واقعی تمرکز می کنند و حتی زمانی که داده های واقعی مورد استفاده قرار می گیرند، در درجه اول فقط برای اعتبار سنجی رابطه پیش بینی شده بین miRNA های اختصاصی و ژنها بکار می روند. یافته های اخیر نشان دادهاند که هنگام استفاده از روش های مبتنی بر توالی، بسیاری از اهداف از دست رفته اند. در این کار، ما یک روش قوی را برای پیش بینی و ارزیابی جفت ژنهای miRNA بر اساس داده های مکانی بیان شده از توالی نسل بعدی و ریزآرایه های DNA ارایه میکنیم. روش اول از الگوی خوشه بندی mean-K برای گروه بندی miRNA ها و ژنها استفاده میکند و پس از آن جفت های miRNA-genes را به یک گراف دو بخشی برای به دست آوردن نتایج آماری تخصیص می دهد. روش توسط اعتبار سنجی متقابل -10 fold بر روی دو مجموعه داده برای دستیابی به کارایی مناسب تست شده اند.
نویسندگان
فهیمه نژادعلی نایی
گروه، مهندسی کامپیوتر ، واحد علوم و تحقیقات خراسان رضوی نیشابور ، دانشگاه آزاد اسلامی ، نیشابور ، ایران
رضا قائمی
گروه، مهندسی کامپیوتر ، واحد قوچان ، دانشگاه آزاد اسلامی ، قوچان ، ایران
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :