روشی برای شناسایی الگوی نواحی کد شده پروتیینی سرطانی و غیرسرطانی توالی هایDNA

سال انتشار: 1394
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 457

فایل این مقاله در 9 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

DCBDP01_024

تاریخ نمایه سازی: 19 خرداد 1396

چکیده مقاله:

با وجود تمام موفقیت ها و پیشرفت هایی که در راستای کنترل و درمان بسیاری از بیماری ها، صورت گرفته است، آمار ابتلا به سرطان به دلیل تنوع و عملکرد درون سلولی آن، همچنان رو به افزایش است. به دلیل ساختار درون سلولی و ژنتیکی بیماری سرطان، توالی های بسیار بزرگ DNA می توان با استفاده از روش های حوزه پردازش سیگنال که در تحلیل توالی های DNA کاربرد دارند، ویژگی هایی متمایز از توالی های سرطانی و غیرسرطانی استخراج کرد که مفهوم ژنتیکی تغییر ساختار این نمونه ها را هم نشان دهد. در این پژوهش، از تبدیل فوریه گسسته پنجره بندی شده به منظور تحلیل و استخراج ویژگی از این سیگنال ها بهره گرفته شده است. در ادامه و با استفاده از روش های ماتریسی و آماری، ویژگی های مهم تر آن انتخاب می شوند. نتایج شبیه سازی الگوریتم ارایه شده نشان می دهد که استفاده از تکنیک پنجره بندی به دلیل مطابقت خوبی که با ساختار نمونه های بزرگ DNA دارد، تغییرات ساختار ژنی منجر به سرطان را در قالب ویژگی تناوب 3- موجود در توالی های DNA نشان می دهد.

کلیدواژه ها:

توالی های DNA تبدیل فوریه گسسته ، سرطان ، ویژگی تناوب- 3 ، ماشین بردار پشتیبان

نویسندگان

امین خدایی

کارشناس ارشد، گروه کامپیوتر، موسسه آموزش عالی نبی اکرم(ص)، تبریز،

بهزاد مظفری تازه کند

دانشیار، دانشکده فنی و مهندسی برق و کامپیوتر، دانشگاه تبریز، تبریز