بهبود پایداری حرارتی آنزیم لوسیفراز به کمک روش محاسباتی یکپارچه با هدف ساخت کاوشگرهای جدید زیستی

سال انتشار: 1395
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 413

فایل این مقاله در 6 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

THCONF01_097

تاریخ نمایه سازی: 18 تیر 1396

چکیده مقاله:

آنزیم لوسیفراز در Renilla reniformis قادر به نشر نور در طیف سبز آبی در طول موج حدود 450 تا 500 نانومتر می باشد و به طور گسترده ای در زیست شناسی مولکولی به عنوان ژن گزارشگر در آزمایشهای کشت سلول و تصویربرداری از بافت کاربرد دارد این انزیم در شرایط هوازی قادر به اکسیداسیون سوبسترای کولنترازین به کولنترامید می باشد و طی این فرایند نوری با طول موج خاص نشر می دهد بیولومیناسنس در مقایسه با سایر روشها، روشی حساس، ساده نسبتا ارزان و غیرتهاجمی جهت بررسی رشد و متاستاز تومور تغییرات ژنتیکی ناحیه توموری و اثر بر بیولوژی تومور می باشد این آنزیم در شرایط in vivo پایداری نسبتا خوبی دارد اما در in vivo پایداری نامطلوبی دارد به همین دلیل به کمک نرم افزارهای بیوانفورماتیکی به روش محاسباتی یکپارچه جهشهایی در ساختار این آنزیم در جهت بهبود پایداری ایجاد شد اثر این جهشها در واحدهای غیر محافظت شده بیررسی شد. بدین منظور ابتدا توالی آمینواسیدی رنیلا از پایگاه NCBI گرفته شد سپس تغییرات پایداری پس از جایگزینی 6 آمینواسید در سرور DUET اعمال شد. بررسی ها نشان داد جهش در تریپتون 36 و جایگزینی آن با گلایسین در توالی آمینواسیدی رنیلا سبب پایداری این پروتیین می شود. بنابراین، این موتاسیون در جایگاه محافظت نشده منجر به تغییرات مثبت در پایدرای پروتیین شده و احتمالا میتواند برای تصویربردرای بیولومیناسنس و ساخت کاوشگرهای جدید زیستی توسط رنیلا لوسیفراز مفید باشد.

نویسندگان

راضیه ایروانی

دانشکده علوم گروه زیست شناسی دانشگاه اصفهان ایران

رحمان امام زاده

دانشکده علوم گروه زیست شناسی دانشگاه اصفهان ایران

محبوبه نظری

استادیار بیوشیمی مرکز تحقیقات آنتی بادی های مونوکلونال ۳ACECR تهران ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Venisnik, K.M., et al., Bifunctional antibo dy-Renilla luciferase fusion protein ...
  • Hastings, J., Biological diversity, chemical mechanisms, and the evolutionary origins ...
  • Loening, A.M., T.D. Fenn, and S.S. Gambhir, Crystal Structures of ...
  • Marey Avenue, 2006, 20/20n Luminometer Operating Manual, , Version: 1.3, ...
  • Nakajima, Y., et al. (2004) Biosci. Biotechnol. Biochem. 68, 565-570. ...
  • Loening, A.M., et al., Consensus guided mutagenesis of Renilla luciferase ...
  • Baldwin, T.O., Firefly luciferase: the structure is known, but the ...
  • Bacart, J., et al., The BRET technology and its application ...
  • Li, J., et al., Cage the firefly luciferin!-a strategy for ...
  • Behrmann, G. and Hardeland, R. 1999. B ioluminescence and diurnal ...
  • نمایش کامل مراجع