مقایسه دو روش PCR مستقیم و PCR با استفاده از DNA استخراج شده توسط کیت در تعیین ژنهای tst و mec A در باکتری استافیلوکوک اوریوس

یکیPCR از دقیق ترین و حساسترین تست ها برای سنجش مولکولی می باشد. استخراج DNA همیشه از وقت گیرترین مراحل قبل از PCR بوده که با حذف آن در برخی شرایط می توان در زمان و هزینه صرفه جویی کرد. هدف از این مطالعه مقایسه دو روش PCR مستقیم و با استخراج DNA الگو در شناسایی ژن های femA mecA tst میباشد. در این بررسی ایزوله های بالینی استافیلوکوک اوریوس با تست های بیوشیمیایی تایید شدند. سپس با روش های PCR مستقیم از کلنی های استافیلوکوک کشت داده شده بر روی محیط مولر هینتون PCR با DNA استخراج شده توسط کیت برای ژنهای tst, mecA,femA مورد ارزیابی قرار گرفت. برای این کار از سه پرایمر اختصاصی استفاده شد. تکثیر ژنهای tst و mec A به طول 326 و bp163 توسط PCR مستقیم و با DNA استخراج شده با موفقیت انجام شد که مربوط به توکسین سندرم شوک توکسیک و مقاومت به متی سیلین می باشند. در نهایت توسط ژنهای مورد نظر سویه های مقاوم و تولید کننده توکسین شناسایی شدند. نتایج بدست آمده از نظر کیفی متفاوت بودند، که آزمون PCR با استفاده از کیت نتایج بدست آمده دارای کیفیت بهتری بود. با توجه به نتایج بدست آمده ، برای صرفه جویی در وقت و هزینه در تشخیص استافیلوکوک اوریوس می توان از PCR مستقیم استفاده کرد. کیفیت باندهای بدست آمده در این روش نسبت به PCR با DNA استخراج شده، قابل قبول بود و در برخی موارد می توان از آن به عنوان یک تست تشخیصی سریع استفاده کرد