جداسازی گونه .Micrococcus sp از درختان انار با عارضه دانه سفیدی در خراسان جنوبی

انار یکی از محصولات باغی مهم در استان خراسان جنوبی می باشد که در سال های گذشته کیفیت میوه با عارضه دانهسفیدی کاهش یافته. باکتری های اندوفیتی به آن دسته از باکتری هایی که بافت داخلی گیاه را کلونیزه می کنند بدوناینکه علایم ظاهری عفونت یا اثر منفی روی میزبانشان را نشان دهند، گفته میشود . در این پژوهش جداسازی اندوفیتهای باکتریایی درختان انار با عارضه دانه سفیدی انجام شد. نمونه برداری از دانه انار از پنج منطقه انارکاری باغ دانشگاهآزاد فردوس و اسلامیه دارای سابقه عارضه سفیدی، باغستان سفلی، با عارضه کم و باغستان علیا و فتح آباد بدون عارضهانجام شد. ویژگی های پرگنه های استرین های جداسازی شده برای هر جدایه ثبت گردید و براساس آزمون های فنوتیپیگروه بندی شدند.داده های حاصل از این آزمایشات صورت مثبت بودن با کد یک و منفی بودن کد صفر مشخص شد ومرتب سازی داده ها در نرم افزار Excel انجام گرفت. داده های حاصل به نرم افزار NTSYS PC وارد شدند. دندروگرامبین جدایه ها به روش UPGMA با ترسیم خوشه ای انجام گرفت.پس از آن جدایه ها با استفاده از PCR شناساییشدند. DNA ژنومی استخراج و ناحیه 16Srna تکثیر و تعیین توالی شد.سپس الکتروفورز نتیجه PCR در ژل وعکسبرداری از ژل انجام شد. توالی های محصولات PCR با استفاده از نرم افزار DNA Star همردیف و مرتب شده ودر پایگاه NCBI داده ها بلاست و شباهت نمونه ها با گونه های شناخته شده تعیین گردید. فیلوژنی نمونه ها با استفادهاز نرم افزار کلاستال دبلیو هم ردیف و سپس در نرم افزار مگا ورژن 6 با استفاده از الگوریتم نزدیکترین همسایگی کلاسترمربوطه ترسیم و مورد مقایسه قرار گرفت. .بر اساس نتایج جنس با فراوانی غالب جداسازی شده از دانه انار دارای علایمدانه سفیدی Micrococcus sp. بود که دارای سلول های گرم مثبت، هوازی و کلنی های باکتری روی محیط TSA، زرد، صاف و دایره ای هستند.