طراحی ایمونوژن نوترکیب دربردارنده زیرواحدهای اتصالی و پیلی علیه باکتری ناتوان کننده ویبریو کلرا
محل انتشار: هفتمین همایش سراسری پدافند جنگ های نوین
سال انتشار: 1396
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 557
فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
NBCCON07_126
تاریخ نمایه سازی: 26 مرداد 1397
چکیده مقاله:
ویبریو کلرا به عنوان یک عامل ناتوان کننده زیستی سبب بروز بیماری خطرناک وبا می شود. از مهمترین عوامل بیماری زایی ویبریوکلرا می توان به فاکتور کلونیزاسیون پیلی و توکسین کلرا می باشند. زیر واحد B انتروتوکسین (CtxB) که مسیول اتصال و وارد کردن بخش عملکردی سم به سلول میزبان را به عهده دارد و TCPA که برای اتصال باکتری و تجمع آن در روده ضروری است، ویژگی های ایمونوژنیک دارند. پروتیین های کایمر دربردارنده اپی توپ و ادجوانت، می توانند سبب افزایش خاصیت ایمونوژنیسیتی پروتیین ها شوند و سبب بروز پاسخ های ایمنی گردند. هدف از تحقیق حاضر استفاده از بیوانفورماتیک در طراحی ایمونوژن کایمر علیه فاکتورهای اتصال و توکسین ویبریو کلرا بود. ژن های کد کننده پروتیین های ctxb و tcpA از بانک ژنی استخراج و به لحاظ وجود کدونهای نادر مورد بررسی قرار گرفتند. با در نظر گرفتن پایداری ساختار ژن کایمر، بهینه سازی ژن ها انجام شد. نیمه عمر و شاخص ناپایداری پروتیین تعیین گردید. ساختارهای دوم و سوم پروتیین پیش بینی و ارزیابی شد . اپی توپ های خطی و فضایی نیز تعیین گردید. شاخص ناپایداری پروتیین کایمر 24/04 بود. شاخص سازگاری کدون سازه کایمر به 0/9 افزایش یافت. در ساختار سوم پیش بینی هر دو پروتیین متاثر از عملکرد لینکرها به صورت مستقل از هم قرار گرفته و از طریفی کیفیت ساختار نیز تایید گردید . ساختار تشکیل شده از mRNA آن نیز پایدار بود. اپی توپ های فضایی و خطی در هر دو دومین پروتیین کایمر دیده شد. با توجه به نتایج بررسی های بیوانفورماتیکی و بیان پروتیین نوترکیب می توان از آن به عنوان ایمونوژن جهت بررسی های ایمنی علیه وبا استفاده شود.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
میلاد عامریان
دانشگاه جامع امام حسین(ع)،دانشکده و پژوهشکده علوم پایه،مرکز علم و فناوری زیست
شهرام نظریان
دانشگاه جامع امام حسین(ع)،دانشکده و پژوهشکده علوم پایه،مرکز علم و فناوری زیست
حسین هنری
دانشگاه جامع امام حسین(ع)،دانشکده و پژوهشکده علوم پایه،مرکز علم و فناوری زیست
محمدابراهیم مینایی
دانشگاه جامع امام حسین(ع)،دانشکده و پژوهشکده علوم پایه،مدیریت جنگ نوین