تشخیص بیماری سرطان با استفاده از روی داده های ریزآرایه RotBoost طبقه بندی کننده ی ترکیبی

سال انتشار: 1388
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 1,320

فایل این مقاله در 6 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

CSICC15_127

تاریخ نمایه سازی: 26 مهر 1388

چکیده مقاله:

تکنولوژی ریزآرایه باعث تولید حجم انبوهی داده دسته بندی در بسیاری از زمینه ها شده است. تحلیل داده های ریزآرایه وکلاس بندی آنها، نشان میدهد این روش در تشخیص بیماریها و سرطان تأثیربسزایی دارد. با توجه به تحقیقات بسیاری که در مورد کلاسبندی دادههای ریزآرایه صورت گرفته است، اعمال روشهای معمول یادگیری ماشین دارای معایبی ذاتی برای رسیدن به یک کلاسبندی پایدار ودقیق است. بنابراین مطلوبتر است که از ترکیب دسته بندی کننده های خبره به جای تکیه بر نتیجه ی تنها یک دسته بندی کننده استفاده شود.در این مقاله، کلاسبندی سرطان، مبتنی بر داده های ریزآرایه با استفاده از یک دسته بندی کننده ی جدید پیشنهاد شده، با نام RotBoost بررسی شده است. این دسته بندی کننده از ترکیب تکنیکهای AdaBoost و Rotation Forest تولید میشود. با توجه به تحقیقات قبلی انجام شده در زمینهی ریزآرایه ها، این اولین باری است که RotBoost بر روی دسته بندی کننده ی داده های ریزآرایه اعمال گردیده است. این تحقیق بر روی 8 مجموعه داده ی ریزآرایه واقعی،پیاده سازی شده و از درخت تصمیم به عنوان دسته بندی کننده ی پایه در آن استفاده شده است. بررسی آزمایشها نشان میدهد که در اکثراین ریزآرایه ها، روش RotBoost از دقت بالاتری نسبت به تکنیکهایی نظیر AdaBoost و RotationForest برخوردار است.

کلیدواژه ها:

داده های ریزآرایه DNA ، دسته بندی کننده ترکیبی ، کلاس بندی سرطان

نویسندگان

فاطمه امین زاده

دانشگاه شهید چمران

علیرضا عصاره

دانشگاه شهید چمران اهواز

بیتا شادگار

دانشگاه شهید چمران اهواز

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • S.-B. Cho, :Exploring features and classifiere to classify gene expression ...
  • C.A. Harrington and CRosenow and J. Retief, ...
  • "Monitoring gene expression using DNA microarrays" Curr. Opin. Microbiol, Vol ...
  • K.R. Coombes and W.E. Highsmith and et al., "Identifying and ...
  • X. Wang and M.J. Hessner and Y Wu and et ...
  • "Quantitative quality control in microarray experiments and the application in ...
  • M. Leblanc and R.Tibshirani, "Combining estimates in regression and classificationf ...
  • M. Skurichina and R.P.W. Duin, "Bagging, boosting and the random ...
  • L.I. Kuncheva and Combining Pattern Classifiers: Methods and Algorithms. Wiley, ...
  • M. Dettling and P. BCuhlmann, :Boosting for tumor classification with ...
  • selection and Geneء [9] D.U. Ramon and A.D.A. Sara, classification ...
  • nove] ensemble machine learning for robust A:ه [10] Y. Peng, ...
  • L. Breiman, "Bagging predictors", Mach. Learn. Vol. 24, pp. 123-140, ...
  • Y. Freund and R.E. Schapire, _ dec ision-theoretic generalization of ...
  • J.J. Rodriguez and L.I. Kuncheva and C.J. Alonso, ...
  • "Rotation forest: A new classifier ensemble method" IEEE Trans. Pattern ...
  • Y. Freund and R.E. Schapire, _ deci sion-theoretic generalization of ...
  • CX. Zhang and JS Zhang , " RotBoost: A technique ...
  • Recognition Letters - Elsevier, Vol. 29, pp. 1524-1536, 2008. ...
  • L. Yu and H. Liu, "Redundancy based feature selection for ...
  • Y. Freund and R.E. Schapire, "Experiments with a new boosting ...
  • Machine Lear. Morgan Kaufmann, Bari, Italy, pp. 148- 156, 1996. ...
  • E. Bauer and R. Kohavi, _ empirical comparison of voting ...
  • L. Breiman and J.Friedman and R. Olshen, Classification and Regression ...
  • T.G. Dietterich, ":Ensemble methods in machine learning, " Proc. of ...
  • L. Hansen and P Salamon, "Neural networks ensembles" IEEE Trans. ...
  • L. Breiman, "Arcing classifiers Ann. Statist. Vol. 26 No. 3, ...
  • K.H. Liu and D.S. Huang, :Cancer classification using Rotation Forest" ...
  • P. Jafari and F Azuaje, _ assessment of recently published ...
  • experimental design and statistical factors" BMC Medict Informatics and Decisio. ...
  • C. Ding and H. Peng. "Minimum redundancy feature selection from ...
  • H. Liu, and J. Li and L. Wong., "A comparative ...
  • J. Li and H. Liu, Kent Ridge Biomedical Data Set ...
  • U. M. Braga-Neto and E.R Dougherty, :Is cros s-validation valid ...
  • نمایش کامل مراجع