ارائه روشی برای تطبیق چندگانه دنباله های پروتئین با استفاده از الگوریتم های ژنتیکی
سال انتشار: 1388
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 1,149
فایل این مقاله در 8 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
CSICC15_169
تاریخ نمایه سازی: 26 مهر 1388
چکیده مقاله:
تطبیق چندگانه دنباله یکی از مسائل مهم در زیست شناسی است که الگوریتم چندجمله ای برای حل آن وجود ندارد. استفاده ازالگوریتمهای ژنتیکی، میتواند جزء راهکارهای مناسب حل این مسئلهباشند. در این مقاله الگوریتمهای ژنتیکی ارائه شده برای این مسئله را بررسی خواهیم کرد و روشی را ارائه میدهیم که تا حد امکان مشکلات این روشها را بهبود بخشد. آزمایشات برای بررسی میزان دقت الگوریتم بر روی مجموعه داده ی ،BAliBASE 2.0 که یک مجموعه ی استاندارد از دنبالههای منطبق شده میباشد، انجام شده است. نتایج نشان میدهد که الگوریتم ارائه شده با استفاده از روش خاص در مقداردهی اولیه جمعیت و استفاده از عملگرهای ساده و دقیق، دقت بهتری را پس از تعداد کمی نسل ژنتیکی نسبت به روشهای مشابه نتیجه داده است. رسیدن به یک پاسخ مناسب پس از ایجاد تعداد کمی نسل ژنتیکی (حدود ۲۰۰۰ ) یکی دیگر از مشکلات الگوریتمهای ژنتیکی موجود که همگرایی کند آنهاست را جبران مینماید.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
زهرا نریمانی
دانشکده مهندسی کامپیوتر دانشگاه صنعتی شریف
حسن ابوالحسنی
دانشکده مهندسی کامپیوتر دانشگاه صنعتی شریف
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :