گروه بندی ارقام مقاوم وحساس به زنگ گندم نان با استفاده از آنالوگ های ژنهای مقاومت به بیماری

خلاصه گندم مهم ترین گیاه زراعی جهان است که به همراه ذرت و برنج بیش از 60 درصد کل کالری و پروتیین مورد نیاز مردم جهان را تامین میکند. بیماری های قارچی به خصوص زنگ های زرد و قهوه ای از جمله عوامل کاهش دهنده عملکرد گندم در ایران و جهان میباشند. در این مطالعه، تنوع ژنتیکی 20 رقم گندم نان مقاوم و حساس به زنگ های قهوه ای و زرد با استفاده از آغازگرهای طراحی شده براساس نواحی حفاظت شده ژن های مقاومت به بیماری بررسی شد. الگوی نواری نشانگرهای چند شکل به صورت غالب امتیازدهی و تعداد نوار تکثیر شده و درصد چند شکلی تعیین گردید. علاوه بر این، برای هر ترکیب آغازگری پارامترهای محتوای اطلاعات چند شکلی (PIC) و شاخص نشانگر (MI) محاسبه شد. از مجموع 11 آغازگر منفرد و جفت، پنج ترکیب آغازگری به همراه یک آغازگر منفرد تکثیر مناسب و قابل امتیازدهی تولید کردند. حداکثر و حداقل PIC به ترتیب مربوط به آغازگر Loop و جفت آغازگر 2016-2020 با میزان 0/50 و 0/28 بود. جفت آغازگرهای 2016-1146 و 2016-2020 با مقادیر 4/80 و 2/84 به ترتیب حداکثر و حداقل MI را داشتند. تجزیه خوشه ای براساس الگوریتم Neighbor-Joining و ضریب تکاملی P-distance ، ارقام مورد مطالعه را به چهار گروه منتسب کرد و این گروهبندی با پاسخ به زنگ زرد ارقام مطابقت داشت. در تجزیه به بردارهای اصلی نیز پراکنش ارقام براساس دو بردار اصلی اول تا حد زیاد چهار گروه حاصل از تجزیه خوشه ای را تایید کرد.