شناسایی مولکولی چهار ویروس مهم جنس نپوویروس از تاکستان های استان زنجان
سال انتشار: 1397
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 418
فایل این مقاله در 12 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_IJPPS-49-1_010
تاریخ نمایه سازی: 20 خرداد 1398
چکیده مقاله:
بهمنظور بررسی وضعیت ویروسهای مهم متعلق به جنس نپوویروس از تاکستانهای استان زنجان، نمونه برداری در سالهای زراعی 95-94 به صورت انتخابی از گیاهان دارای نشانه های مشکوک به بیماری های ویروسی انجام و درمجموع 168 نمونه گیاهی دارای نشانه و بدون نشانه گرد آوری شد. استخراج آر.ان.ای کل از بافتهای برگی و آوندی 57 نمونه بر اساس نشانه ها و مناطق نمونه برداری شده انجام گرفت و cDNA آنها ساخته شد و سپس، آزمون پیسیآر توسط آغازگرهای اختصاصی برای تکثیر (افزونش) بخشی از ژنگان (ژنوم) نپوویروس های موزاییک آرابیس (Arabis mosaic virus, ArMV)، بدشکلی انگور (Grapevine deformation virus, GDeV)، برگ بادبزنی انگور (Grapevine fanleaf virus, GFLV) و لکه حلقوی گوجهفرنگی (Tomato ring spot virus, ToRSV) انجام گرفت. نتایج واکنش زنجیرهای پلمیراز گویای تکثیر قطعه های مورد انتظار از ویروس های ArMV، GDeV، GFLV و ToRSV به ترتیب از 7/15، 7/15، 5/10 و 14 درصد نمونهها بود. پس از تعیین توالی، همردیف سازی ترادف نوکئوتیدی قطعه های تکثیرشده با دیگر توالی های موجود در بانک ژن و تحلیل تبارزائی توسط برنامه MEGA6، با روش Neighbor-Joining انجام شد. بررسی رابطه های تبارزائی بر اساس توالیهای نوکلئوتیدی نشان داد، جدایههای ردیابیشده در این تحقیق با جدایههایی از کشورهای مختلف همگروه اند که در بیشتر موارد ارتباط جغرافیایی بین جدایه های ردیابی شده و دیگر جدایه ها را نشان می دهد. این نخستین تحقیق جامع بر اساس دادههای مولکولی از نپوویروسهای مهم انگور در استان زنجان و نخستین گزارش ویروس بدشکلی انگور از این منطقه است.
کلیدواژه ها:
آرتی پی سی آر ، ویروس بدشکلی مو ، ویروس برگ بادبزنی مو ، ویروس لکه حلقوی گوجه فرنگی ، ویروس موزاییک آرابیس
نویسندگان
رقیه مرادی
دانشجوی سابق کارشناسی ارشد، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگان زنجان
داود کولیوند
استادیار، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگان زنجان
امید عینی گندمانی
استادیار، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگان زنجان
محمد حاجی زاده
استادیار، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان. سنندج
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :