شناسایی SNP ها بین دو گونه ی Ocimum basilicum و Ocimum tenuiflorum به روش silico In

ریحان (.Ocimum basilicum L) گیاهی یکساله متعلق به خانواده ی نعناعیان و غنی از ترکیبات فنیل پروپانوئیدی و ترپن ها می باشد که به اسانس این گیاه خاصیت دارویی بخشیده است. در این تحقیق به منظور شناسایی تنوع های تک نوکلئوتیدی (SNP ها) در نواحی کد کننده برخی ژن ها مهم دخیل در بیوسنتز فنیل پروپانوئیدها بین دوگونه O.basilicum و O. tenuiflorum از روش In Silico استفاده شد. بدین منظور ابتدا توالی نواحی کد کننده چهار ژن درگیر در این مسیر (اوژنول O- متیل ترنسفراز، سینامیل الکل دهیدروژناز، 4- کومارات کوآنزیم آ لیگاز و کافتیک اسید O- متیل ترانسفراز) در دو گونه ی O. basilicum و O. tenifoulium از سایت NCBI دانلود گردید و سپس با استفاده از نرم افزار Clastal omega هم ردیفی انجام و SNP ها شناسایی شد. نتایج هم ردیفی بین این دوگونه نشان داد که تبدیل بازهای A<-> G و T<-> C در توالی چهار ژن مورد مطالعه به فراوانی وجود دارند ولی در ژن اوژنول O- متیل ترانسفراز 113SNP یافت گردید که در مقایسه با دیگر ژن های مورد مطالعه بالاترین تنوع مشاهده شده بود. همچنین درج و حذف باز در این ژن مشاهده گردید که در سایر ژن ها وجود نداشت. به طور کلی نتایج این تحقیق نشان داد که تنوع تک نوکلئوتیدی در بین گونه های مختلف ریحان به فراوانی مشاهده می شود.