ارزیابی آزمون LAMP با خصوصیت رنگ سنجی جهت ردیابی چشمی Ralstonia solanacearum در محموله های سیب زمینی ایستگاه های قرنطینه ای ایران

سال انتشار: 1398
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 431

فایل این مقاله در 7 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JPP-31-2_014

تاریخ نمایه سازی: 6 اسفند 1398

چکیده مقاله:

نژاد 2، بیووار 2 از کمپلکس گونه ای Ralstonia solanacearumخسارات اقتصادی قابل توجهی را به سیب زمینی در سراسر دنیا وارد می سازدو. بنابراین دستیابی به روش ردیابی حساس و اختصاصی به منظور حذف مواد گیاهی آلوده در مراکز تحقیقات وایستگاه های بازرسی قرنطینه گیاهی ضروری می باشد. در مطالعه حاضر پس از جداسازی کلنی های شبیه R. solanacearum از غده های آلوده سیب زمینی در محیط تترازولیوم کلراید، تایید مولکولی گونه با استفاده از آغازگرهای اختصاصی انجام گرفت. براساس آزمون استفاده از منابع کربنی و واکنش زنجیره ای پلیمراز اختصاصی نیزف جدایه های بدست آمده متعلق به بیووار 2 و فیلوتایپ IIمی باشند. ازمون بیماری زایی بر روی گیاهچه های سیب زمینی و گوجه فرنگی برای جدایه ها انجام و بیماری زایی جدایه ها بررسی گردید. ارزیابی غده های آلوده و یا مشکوک به آلودگی با اعمال PCR سنتی و واکنش LAMP بر روی ژن fliC با استفاده از DNA ی استخراج شده و عصاره آلوده سیب زمینی انجام گرفت. الگوی نردبانی محصو.لات LAMP و ردیابی چشمی رسوب پیروفسفات و یا تغییر رنگ ایجاد شده درنمونه های آلوده با واسط کاربردکالسیین ،دلالت بر ردیابی موفق R. solanacearum توسط واکنش LAMP دارد. اگرچه حساسیت آزمون LAMP و CFU/ml 10(4) مساوی و یا کمتر از PCR سنتی است. اما دقت واکنش مزبور جهت تایید قابل اطمینان وجود R. solanacearum در غده های سیب زمینی کافی می باشد. در مجموع، ازمون LAMP به همراه مرحله آشکارسازی کارایی چون استفاده از کالسیین، اطلاعات اولیه مناسبی را جهت غربالگری غده های آلوده قبل ازانبارداری در حین حمل ونقل استانی مهیا می سازد.

نویسندگان

امه هانی نبوی چاشمی

دانش آموخته کارشناسی ارشد گروه گیاهپزشکی دانشکده کشاورزی دانشگاه فردوسی مشهد

ساره بقایی راوری

دانشیار گروه گیاهپزشکی دانشکده کشاورزی دانشگاه فردوسی مشهد

ماهرخ فلاحتی سازگار

استاد گروه گیاهپزشکی دانشکده کشاورزی دانشگاه فردوسی مشهد

کبری مسلم خانی

مربی آموزشی گروه گیاهپزشکی دانشکده کشاورزی دانشگاه فردوسی مشهد

وحید جهانبخش مشهدی

استادیار موسسه تحقیقات ثبت و گواهی بذر و نهال، سازمان تحقیقات آموزش و ترویج کشاورزی تهران ایران