تجزیه مولکولی تنوع و روابط ژنتیکی ژنوتیپ‌های بومی جو بر اساس نشانگرهای ریزماهواره

سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 282

فایل این مقاله در 14 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_PGRLU-1-1_005

تاریخ نمایه سازی: 16 اسفند 1399

چکیده مقاله:

ژنوتیپ‌های بومی به‌دلیل تطابق و سازگاری با شرایط محیطی مختلف، ذخایر ژنتیکی با ارزشی برای افزایش تنوع ژرم‌پلاسم‌های اصلاحی و نیز منابع بالقوه برای ژن‌های مقاومت به تنش‌های زیستی و غیرزیستی بشمار ‌می‌روند. در این مطالعه، تنوع و ساختار ژنتیکی 119 ژنوتیپ بومی جو از کشورهای مختلف و 25 رقم تجاری و لاین اصلاحی با استفاده از 45 جفت آغازگر ریزماهواره مورد ارزیابی قرار گرفت. در مجموع 225 آلل با دامنه 2 تا 14 و میانگین 5 آلل به ازای هر جایگاه تکثیر شدند. میزان اطلاعات چندشکلی برای نشانگرها بین 05/0 تا 90/0 با میانگین 51/0 متغیر بود. کمترین و بیشترین فراوانی آلل شایع به‌ترتیب مربوط به نشانگرهای EBMAC0788 (13/0) و GBM1411 (97/0) بود. تجزیه واریانس مولکولی نشان داد که واریانس درون‌گروهی (94 درصد) سهم بیشتری در تبیین واریانس مولکولی کل در مقایسه با واریانس بین گروهی داشت. حداکثر و حداقل شاخص‌های شانون و تنوع ژنی نی به‌ترتیب به ژنوتیپ‌های بومی ایران و مصر تعلق داشت. تجزیه خوشه‌ای با استفاده از الگوریتم Minimum Evolution و ضریب فاصله P-distance ژنوتیپ‌ها را به سه گروه منتسب کرد. این گروه‌بندی تا حدودی با مناطق جغرافیایی ژنوتیپ‌ها مطابقت داشت.

نویسندگان

علی شوروزدی

Former M.Sc. Student, Department of Plant Breeding and Biotechnology, University of Tabriz, Tabriz, Iran

سید ابوالقاسم محمدی

Professor, Department of Plant Breeding and Biotechnology, University of Tabriz, Tabriz, Iran

مجید نوروزی

Assistant Professor, Department of Plant Breeding and Biotechnology, University of Tabriz, Tabriz, Iran

بهزاد صادق زاده

Assistant Professor, Dryland Agriculture Research Institute of Iran, Maragheh, Iran

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Abdollahi-Sisi, N., Mohammadi, S.M., Alavi-kia, S.S. and Sadeghzadeh, B. (2012). ...
  • Abede, T.D., Mathew, B. and Le´on, J. (2013). Barrier analysis ...
  • Botstein, D., White, R.L., Skolnick, M. and Davis, R.W. (1980). ...
  • Brush, S. and Meng, E. (1998). Farmer’s valuation and conservation ...
  • Chen, Z.W., Lu, R.J., Zou, L., Du, Z.Z., Gao, R.H., ...
  • Condon, F., Charles-Gustus, D., Rasmusson, C. and Kevi, D.S. (2008). ...
  • Ebrahimi, A., Naghavi, M.R., Sabokdast, M. and Mardi, M. (2010). ...
  • Excoffier, L., Smouse, P. and Quattro, J.M. (1992). Analysis of ...
  • FAO. (2013). FAO Statistical Database (FAOSTAT), Web site at URL: ...
  • Ganjekhanloo, A., Mohammadi, S.A., Moghaddam, M., Shakiba, M.R., Ghasemi-Golezani, K.and ...
  • Gong, X., Westcott, S., Li, C., Yan, G., Lance, R. ...
  • Hamza, S., Hamida, W.B., Rebai, A. and Harrabi, M. (2004). ...
  • Heidari, A., Mohammadi, S.A., Moghaddam, M., Shakiba, M.R., Ghasemi-Golezani, K. ...
  • Ivandic, V., Hackett, C.A., Nevo, E., Keith, R., Thomas, W.T. ...
  • Jia, Q.J., Zhu, J.H., Wang, J.M. and Yang, J.M. (2010). ...
  • Jones, H., Civáň, P., Cockram, J., Leigh, F.J., Smith, L.M.J., ...
  • Joshi, S.P., Ranjekar, P.K. and Gupta, V.S. (1999). Molecular markers ...
  • Kadri, K., Abdellawi, R. and Cheikh-Mhamed, H. (2009). Genetic diversity ...
  • Kanbar, A. and Katsuhiko, K. (2011). Efficiency of ISSR and ...
  • Kandemir, N., Yildirim, A. and Gunduz, R. (2010). Determining the ...
  • Karim, K., Rawda, A. and Hatem, C. (2010). Genetic diversity ...
  • Leišová, L. and Kučera, L. (2010). The use of microsatellites ...
  • Liu, K. and Muse, S.V. (2005). Power Marker: an integrated ...
  • Mango, T., Carrierosu, F., Cifavell, R.A., Gallitelli, M. and Callini, ...
  • Matus, I.A. and Hayes, P.M. (2002). Genetic diversity in three ...
  • Mohammadi, S.A. and Prasanna, B.M. (2003). Analysis of genetic diversity ...
  • Nei, M. (1973). Analysis of gene diversity in subdivided populations. ...
  • Pandey, M.P., Wagner, C., Friedt, W. and Ordan, F. (2004). ...
  • Peakall, R. and Smouse, P.E. (2006). GENALEX 6.4: Genetic analysis ...
  • Pillen, K., Binder, A., Kreuzkam, B., Ramsay, L., Waugh, R., ...
  • Saghai Maroof, M.A., Solaiman, K., Tprgensen, R.A. and Allard, R.W. ...
  • Stam, B.K., Bothmer, A., Dayteg, R., Rashal, C., Tuvesson, S. ...
  • Tamura, K., Dudley, J., Nei, M. and Kumar, S. (2011). ...
  • Wang, M.L., Barkley, N.A., Yu, J.K., Dean, R.E., Newman, M.L., ...
  • Yahiavi, S., Igartua, E., Moralejo, M., Ramsay, L., Molina-Cano, J.L., ...
  • Yeh, F.C., Yang, R.C. Boyle, T.B.J., Ye, Z.H. and Mao, ...
  • Zhu, J., Gale, M.D., Quarrie S., Jackson, M.T. and Bryan, ...
  • Zoghlami, N., Bouagila, A., Lamine, M., Hajri, H. and Ghorbel, ...
  • Zong-Yun, F., Xian-Jun, L., Yi-Zheng, Z. and Hong-Qing, L. (2006). ...
  • نمایش کامل مراجع