ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

خاموشی ژن bZIP۱۴ با استفاده از CRISPR/Cas۹ و بررسی موتانت ها در پاسخ به تنش شبکه آندوپلاسمی در گیاه Marchantia polymorpha

محل انتشار: دوفصلنامه مهندسی ژنتیک و ایمنی زیستی، دوره: 9، شماره: 2
سال انتشار: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 264

فایل این مقاله در 11 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:
https://civilica.com/doc/1274294

شناسه ملی سند علمی:

JR_GEB-9-2_014

تاریخ نمایه سازی: 4 مهر 1400

چکیده مقاله:

انباشته شدن پروتئین های تانخورده و بد-تاخورده سبب تنش شبکه آندوپلاسمی می شود. در پاسخ به تنش شبکه آندوپلاسمی، پاسخ به پروتئین تانخورده (UPR) توسط حس گرهای تراغشایی شبکه آندوپلاسمی راه اندازی می شود. این مسیر مجموعه ای از سیگنال های پیام رسان یکپارچه است که برای بازگرداندن پایداری شبکه آندوپلاسمی طراحی شده است. دو فاکتور رونویسی bZIP به نام های bZIP۱۴ و bZIP۷ مسیر UPR را در گیاه Marchantia polymorpha تنظیم می کنند. در این مطالعه لاین های موتانت bzip۱۴ با استفاده از فناوری CRISPR/Cas۹ در گیاه مارکانتیا جمع آوری شده است. بدین منظور توالی DNA ژن bZIP۱۴ در پایگاه اطلاعاتی Marchantia.info به کمک Blastp برای گیاه مارکانتیا شناسایی شد. بدین منظور، توالی DNAی ژن  bZIP۱۴ با انجام بلاست پروتئینی در وبگاه Marchantia.info شناسایی شد. توالی اگزون به منظور شناسایی sgRNAها در پایگاهhttp://crispor.tefor.net/  وارد و از میان sgRNAهای پیشنهادی، سه کاندید انتخاب شدند. sgRNAها درون سازه اختصاصی CRISPR/Cas۹ برای گیاه مارکانتیا به نام pMpGE۰۱۳ وارد و پس از انتقال به اگروباکتری سویه GWB۳۰۳+pSOUP به گیاه انتقال داده شد. از گیاهان باززا شده در محیط انتخابی دارای هایگرومایسین، استخراج DNA انجام و پس از تکثیر با پرایمرهای اختصاصی، برای توالی یابی ارسال شد. هشت لاین از ۱۱ لاین با توالی صحیح، تغییرات نوکلئوتیدی حذف و اضافه در توالی DNA نشان دادند. یک لاین موتانت انتخاب و برای ارزیابی فنوتیپی و آزمون زنده مانی به محیط حاوی ترکیب تونیکامایسین، ماده شیمیایی القا کننده تنش شبکه آندوپلاسمی انتقال یافت. بررسی ها نشان داد که bZIP۱۴ تنها هومولوگ ژن های bZIP۱۷ و bZIP۲۸ در گیاه آرابیدوپسیس است. همچنین تحت تنش شبکه آندوپلاسمی، گیاهان موتانت در مقایسه با گیاهان وحشی تفاوت معناداری در سطح ۵ درصد نشان داده اند.   

کلیدواژه ها:

نویسندگان

آزاده محسنی

Department of crop biotechnology and breeding, Ferdowsi University of Mashhad, Iran

محمد فارسی

Department of crop biotechnology and breeding, Ferdowsi University of Mashhad, Iran

علیرضا سیفی

Department of crop biotechnology and breeding, Ferdowsi University of Mashhad, Iran

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Bao, Yan, Diane C. Bassham, and Stephen H. Howell. ۲۰۱۹. ...
  • Bao, Y. and Howell, S.H. ۲۰۱۷. The unfolded protein response ...
  • Che, P., Bussell, J.D., Zhou, W., Estavillo, G.M., Pogson, B.J. ...
  • Deltcheva, E., Chylinski, K., Sharma, C.M., Gonzales, K., Chao, Y., ...
  • Doench, J.G., Hartenian, E., Graham, D.B., Tothova, Z., Hegde, M., ...
  • Godinez-Vidal, D., López-Leal, G., Covarrubias, A.A. and Reyes, J.L. ۲۰۲۰. ...
  • Henriquez‐Valencia, C., Moreno, A.A., Sandoval‐Ibañez, O., Mitina, I., Blanco‐Herrera, F., ...
  • Humbert, S., Zhong, S., Deng, Y., Howell, S.H. and Rothstein, ...
  • Howell, S.H. ۲۰۱۳. Endoplasmic reticulum stress responses in plants. Annual ...
  • Ishizaki, K., Johzuka-Hisatomi, Y., Ishida, S., Iida, S. and Kohchi, ...
  • Iwata, Y., Ashida, M., Hasegawa, C., Tabara, K., Mishiba, K.I. ...
  • Kim, J.S., Yamaguchi-Shinozaki, K. and Shinozaki, K. ۲۰۱۸. ER-Anchored Transcription ...
  • Kubota, A., Ishizaki, K., Hosaka, M. and Kohchi, T. ۲۰۱۳. ...
  • Liang, G., Zhang, H., Lou, D. and Yu, D. ۲۰۱۶. ...
  • Liu, J.X., Srivastava, R., Che, P. and Howell, S.H. ۲۰۰۷. ...
  • Liu, J.X., Srivastava, R. and Howell, S.H. ۲۰۰۸. Stress‐induced expression ...
  • Ma, X., Zhang, Q., Zhu, Q., Liu, W., Chen, Y., ...
  • Mojica, F.J., Díez-Villaseñor, C., García-Martínez, J. and Almendros, C. ۲۰۰۹. ...
  • Pastor-Cantizano, N., Ko, D.K., Angelos, E., Pu, Y. and Brandizzi, ...
  • Pu, Y., Ruberti, C., Angelos, E.R. and Brandizzi, F. ۲۰۱۹. ...
  • Ruberti, C., Lai, Y. and Brandizzi, F. ۲۰۱۸. Recovery from ...
  • Sauret-Gueto, S., Frangedakis, E., Silvestri, L., Rebmann, M., Tomaselli, M., ...
  • Sugano, S.S., Nishihama, R., Shirakawa, M., Takagi, J., Matsuda, Y., ...
  • Sun, L., Lu, S.J., Zhang, S.S., Zhou, S.F., Sun, L. ...
    • نمایش کامل مراجع