ارزیابی تنوع ژنتیکی بین و درون تیپ های مختلف توتون با استفاده از نشانگرهای IRAP و REMAP
محل انتشار: پژوهشنامه اصلاح گیاهان زراعی، دوره: 7، شماره: 16
سال انتشار: 1394
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 256
فایل این مقاله در 9 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JCB-7-16_001
تاریخ نمایه سازی: 17 مهر 1400
چکیده مقاله:
در این مطالعه بهمنظور بررسی تنوع ژنتیکی ۴۵ ژنوتیپ از ژرمپلاسم تیپهای مختلف توتون شامل گرمخانهای، بارلی و شرقی، از ۲۰ ترکیب آغازگری IRAP و REMAP استفاده شد که از بین این آغازگرها، ۵ آغازگر IRAP و ۹ آغازگر REMAP قادر به تولید الگوی نواری، با وضوح و چندشکلی بالا بودند و در مجموع ۱۸۸ مکان را تکثیر کردند که از این تعداد ۱۵۳ مکان، چندشکل بودند. آغازگر RTR-۱۰ با ۲۲ نوار و RTR-۱ با ۱۶ نوار، بیشترین و آغازگر UBC۸۱۷+RTR۱ با ۴ نوار، کمترین تعداد مکانهای چند شکل را تکثیر کردند. میزان اطلاعات چندشکل نشانگرها بین ۱۶/۰ تا ۳۳/۰ و شاخص نشانگر از ۳۴/۰ تا ۲۵/۶ در کل ژنوتیپهای مورد مطالعه متغیر بود. تجزیه خوشهای به روش UPGMA، ۴۵ ژنوتیپ مورد مطالعه را در پنج گروه قرار داد، که گروه اول شامل تیپ بارلی، گروه دوم شامل تیپ گرمخانهای و گروههای ۳، ۴ و ۵ شامل ژنوتیپهای شرقی شدند. صحت گروهبندی حاصل از تجزیه خوشهای توسط تابع تشخیص کانونی به روش خطی فیشر ۳/۷۳ درصد تایید شد.
کلیدواژه ها:
Retrotransposon ، Simple Matching Coefficient ، Polymorphism InformationContect ، رتروترانسپوزون ، ضریب تشابه انطباق ساده ، میزان اطلاعات چندشکل
نویسندگان
سیده فاطمه حسنی تسیه
دانشگاه گیلان،
حبیب الله سمیع زاده لاهیجی
دانشگاه گیلان،
مرداویج شعاعی دیلمی
مرکز تحقیقات توتون گیلان
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :