تجزیه ارتباط و ساختار بخشی از ذخایر ژنتیکی برنج (Oryza sativa L.) بر اساس نشانگرهای ریزماهواره

سال انتشار: 1396
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 200

فایل این مقاله در 16 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_CRGU-7-1_001

تاریخ نمایه سازی: 3 آبان 1400

چکیده مقاله:

ارزش اقتصادی یک رقم به صفات مختلف آن بستگی دارد و از این­رو اطلاع دقیق از رفتار ژنتیکی و شناسایی مکان­های ژنومی دخیل در کنترل این صفات می­تواند به به­نژادگر در اصلاح ارقام کمک کند. در این تحقیق، ارتباط و پیوستگی بین ۲۵ نشانگر ریزماهواره با برخی از صفات مهم زراعی و مرفولوژیک در ۱۲۱ لاین و رقم مختلف برنج از طریق مدل­های ارتباط­یابی شامل مدل خطی عمومی (GLM) و مدل خطی مخلوط (MLM) با استفاده از نرم­افزارهای Structure و Tassel مورد ارزیابی قرار گرفت. بر اساس ۲۵ نشانگر ریزماهواره مورد استفاده در این مطالعه، ساختار ژنتیکی جمعیت به پنج زیرجمعیت فرعی (۵=K) تقسیم شد که نتایج حاصل از رسم بارپلات نیز آن­را تایید کرد. در تجزیه ارتباطی با دو روش GLM و MLM، به­ترتیب ۲۶ و ۳۰ نشانگر، ارتباط معنی­داری را با صفات مورد مطالعه نشان دادند و تغییرات قابل توجهی از این صفات را توجیه کردند. وجود نشانگرهای مشترک در میان برخی صفات بررسی شده مانند ارتباط معنی­دار نشانگر RM۵ با صفات طول و عرض برگ پرچم و نشانگر RM۳۳۵۵ با صفات تعداد روز تا ۵۰ درصد گلدهی و ارتفاع بوته می­تواند ناشی از آثار پلیوتروپی و یا پیوستگی نواحی ژنومی دخیل در این صفات باشد. همچنین، نشانگرهای RM۱۹۰ و RM۶۰۸۰ با ضریب تبیین بالابه­ترتیب با صفات طول شلتوک و عملکرد دانه منتسب شدند که می­توانند پس از آزمایش­های تکمیلی و تایید نتایج، به­منظور شناسایی ژن­های رمزکننده این صفات، ناحیه ژنومی مربوطه اشباع و توالی­یابی شوند.

نویسندگان

حیدر عزیزی

دانش آموخته دکتری، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده علوم کشاورزی دانشگاه گیلان، رشت، ایران

علی اعلمی

استادیار، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده علوم کشاورزی دانشگاه گیلان، رشت، ایران

مسعود اصفهانی

استاد، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده علوم کشاورزی دانشگاه گیلان، رشت، ایران

علی اکبر عبادی

استادیار پژوهش، بخش اصلاح و تهیه بذر، موسسه تحقیقات برنج کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، رشت، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Agrama, H. A., Eizenga, G. C. and Yan, W. ۲۰۰۷. ...
  • Allahgholipour, M., Mohammad Salehi, M. S. and Ebadi, A. A. ...
  • Al-Maskri, A. H., Sajjad, M. and Khan, S. H. ۲۰۱۲. ...
  • Andersen, J. R., Zein, I., Wenzel, G., Krützfeldt, B., Eder, ...
  • Anderson, J. A., Churchill, G. A., Autrique, J. E. and ...
  • Breseghello, F. and Sorrells, M. E. ۲۰۰۶. Association mapping of ...
  • Ching, A., Caldwell, K. S., Jung, M., Dolan, M., Smith, ...
  • Das, B., Sengupta, S., Parida, S. K., Roy, B., Gosh, ...
  • DeWan, A., Liu, M., Hartman, S. and Zhang, S. S. ...
  • Doerge, R. W. ۲۰۰۲. Mapping and analysis of quantitative trait ...
  • Evanno, G., Regnaut, S. and Goudet, J. ۲۰۰۵. Detecting the ...
  • FAO. ۲۰۱۳. Food and agriculture organization of the United States. ...
  • Gupta, P. K., Rustgi, S. and Kulwal, P. L. ۲۰۰۵. ...
  • IRRI. ۲۰۰۲. Standard evaluation system for rice. International Rice Research ...
  • Jia, L. M., Yan W. G., Zhu, C. S., Agrama, ...
  • Jin, L., Lu, Y., Xiao, P., Sun, M., Corke, H. ...
  • Jun, T. H., Van, K., Kim, M. Y., Lee, S. ...
  • Kiani, Gh. and Nematzadeh, Gh. ۲۰۱۲. Assessment of genetic variability ...
  • Kovi, M. R., Hu, Y., Bai, X. and Xiang, Y. ...
  • Liu, L., Wang, L., Yao, J., Zheng, Y. and Zhao, ...
  • Maccaferri, M., Sanguineti, M. C., Demontis, A. and El-Ahmed, A. ...
  • Mackay, T. F., Stone, E. A. and Ayroles, J. F. ...
  • Mardani, Z., Rabiei, B., Sabouri, H. and Sabouri, A. ۲۰۱۳. ...
  • Mauricio, R. ۲۰۰۱. Mapping quantitative trait loci in plants: Uses ...
  • Mokrani, L., Gentzbittel, L., Azanza, F., Fitamant, L., Al-Chaarani, G. ...
  • Pasam, R. K., Sharma, R., Malosetti, M. and Van Eeuwijk, ...
  • Pritchard, J. K. and Donnelly, P. ۲۰۰۱. Case-control studies of ...
  • Pritchard, J. K., Stephens, M. and Donnelly, P. ۲۰۰۰. Inference ...
  • Rahimi, M., Rabiei, B., Ramezani, M. and Movafegh, S. ۲۰۱۰. ...
  • Remington, D. L., Thornsberry, J. M., Matsuoka, Y., Wilson, L. ...
  • Rogers, S. O. and Bendich, A. J. ۱۹۸۵. Extraction of ...
  • Sabouri, A., Rabiei, B., Toorchi, M., Aharizad, S. and Moumeni, ...
  • Semagn, K., Bjørnstad, A. and Xu, Y. ۲۰۱۰. The genetic ...
  • Slatkin, M. ۱۹۹۴. An exact test for neutrality based on ...
  • Spataro, G., Tiranti, B., Arcaleni, P. and Bellucci, E. ۲۰۱۱. ...
  • Triphati, K. K., Govila, O. P., Warreir, R. and Ahuja, ...
  • Tuberosa, R., Gill, B. S. and Quarrie, S. A. ۲۰۰۲. ...
  • Vanniarajan, C., Vinod, K. K. and Pereira, A. ۲۰۱۲. Molecular ...
  • Wen, W., Mei, H., Feng, F., Yu, S., Huang, Z., ...
  • Yu, J. and Buckler, E. S. ۲۰۰۶. Genetic association mapping ...
  • Yu, J. M., Pressoir, G., Briggs, W. H. and Bi, ...
  • Zheng, H., Wang, J., Zhao, H., Liu, H., Sun, J., ...
  • Zhu, J., Gale, M. D., Quarrie, S., Jackson, M. T. ...
  • Zietkiewicz, E., Rafalski, A. and Labuda, D. ۱۹۹۴. Genome fingerprinting ...
  • نمایش کامل مراجع