تنوع ژنتیکی جدایه های مختلف نوکلئوپلی هیدروویروس(HaNPV) در استان های مازندران و گلستان با استفاده از نشانگر مولکولی RAPD.
محل انتشار: فصلنامه گیاه پزشکی کاربردی، دوره: 3، شماره: 2
سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 222
فایل این مقاله در 12 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_PLNTI-3-2_004
تاریخ نمایه سازی: 29 تیر 1401
چکیده مقاله:
کرم غنچه توتون (Helicoverpa armigera) یکی از آفات مهم و کلیدی مزارع توتون محسوب می شود. ویروس چند وجهی هستهای (Nucleopolyhedrovirus) یکی از عوامل مهم کنترل بیولوژیک علیه کرم غنچه و تعدادی از گونههای دیگر می باشد. این تحقیق با هدف بررسی تنوع ژنتیکی جدایههای مختلف نوکلئوپلی هیدروویروس در ۱۶ جمعیت طبیعی استانهای مازندران و گلستان انجام شد. نمونههای کرم غنچه توتون آلوده به ویروس از مزارع توتون در استانهای مازندران و گلستان جمعآوری شدند. خالصسازی ویروس و استخراج DNA با استفاده از روش CTAB انجام شد. در آزمون نشانگرهای RAPD ابتدا از ده جفت آغازگر جهت تکثیر DNA ویروس NPV استفاده گردید که از بین آنها دو جفت آغازگر که بیشترین پلیمورفیسم را داشتند، انتخاب شدند. این دو جفت آغازگر روی ۱۶ نمونه DNA مربوط به جدایههای مناطق جغرافیایی مختلف بررسی شدند. دو جفت آغازگر مورد استفاده همگی نوارهای قابل کدگذاری ایجاد کردند. پس از الکتروفورز محصولات PCR، در مجموع تعداد ۸۷ باند قابل امتیازدهی به دست آمد که از بین آنها، ۷۵ باند (۸۶ درصد) دارای چندشکلی بودند. تجزیه و تحلیل دادهها با استفاده از نرم افزارPyElph انجام شد. پس از گروهبندی جمعیتها با روش UPGMA در فاصله ژنتیکی ۲۰، پنج شاخه اصلی مشاهده شد که این بیانگر وجود تنوع ژنتیکی میان جدایههای مورد بررسی بود، ولی این تنوع ژنتیکی با توزیع جغرافیایی جدایهها مطابقت زیادی نداشت. با مبنا قرار دادن نشانگرRAPD جدایههایی از نوکلئوپلی هیدروویروس با بیشترین قرابت ژنتیکی در یک خوشه ژنی قرار گرفتند و بیشترین شباهت را نشان دادند. نتایج ثابت کرد که بین جدایههای مطالعه شده تنوع خوبی وجود داشت که جهت برنامههای به نژادی و همچنین کنترل بیولوژیک میتوان از آنها استفاده نمود.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
مرضیه شازده احمدی
محققین مرکز تحقیقات و آموزش توتون تیرتاش، بهشهر، مازندران، ایران
هدی عاصمی
محققین مرکز تحقیقات و آموزش توتون تیرتاش، بهشهر، ایران
زین العابدین شهادتی مقدم
محققین مرکز تحقیقات و آموزش توتون تیرتاش، بهشهر، ایران
سید افشین سجادی
محققین مرکز تحقیقات و آموزش توتون تیرتاش، بهشهر، ایران