اثر خطای تعیین ژنوتیپ نشانگر در صحت پیش بینی ارزش اصلاحی ژنومی در صفات آستانه ای

سال انتشار: 1402
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 121

فایل این مقاله در 13 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJAS-54-2_006

تاریخ نمایه سازی: 13 تیر 1402

چکیده مقاله:

هدف از این مطالعه بررسی اثر خطای تعیین ژنوتیپ نشانگر و نوع طرح آمیزشی و انتخابی (ارزش اصلاحی و فنوتیپی) در صحت ارزیابی ژنومی تحت سطوح مختلف وراثت پذیری (۰۵/۰، ۱/۰ و ۳/۰) و تراکم نشانگرها (۵۰۰، ۱۰۰۰ و ۱۵۰۰) به وسیله­ی شبیه­سازی در صفت آستانه ای بود. ژنومی شامل دو کروموزوم هر یک به طول ۱۰۰ سانتی مورگان، و بر روی هر کروموزوم ۱۲۵ QTL شبیه سازی شد. به منظور شبیه­سازی صفت آستانه­ای، ۲۰ درصد از فنوتیپ برتر در هر نسل دو و مابقی یک در نظر گرفته شدند. ارزش اصلاحی ژنومی با استفاده از اثرات نشانگری برآورد شده توسط روش آماری بیز B پیش­بینی شد. صحت ارزیابی­های ژنومی نشان داد که طرح آمیزشی و انتخابی ارزش اصلاحی در مقایسه با طرح آمیزشی و انتخابی فنوتیپی صحت بیشتری دارد. صحت ارزیابی­های ژنومی با افزایش خطای تعیین ژنوتیپ در هر دو طرح آمیزشی و انتخابی ارزش اصلاحی و فنوتیپی کاهش یافت. نتایج نشان داد با افزایش درصد خطای تعیین ژنوتیپ، افزایش تراکم نشانگر منجر به افزایش صحت پیش­بینی ارزیابی ژنومی می شود.

کلیدواژه ها:

طرح آمیزشی و انتخابی ، وراثتپذیری ، روش بیز B

نویسندگان

میثم لطیفی

محقق مستقل (دکتری ژنتیک و اصلاح نژاد دام)، دانشکده کشاورزی، گروه علوم دامی، دانشگاه کردستان، کردستان، ایران

یوسف نادری

گروه علوم دامی، واحد آستارا، دانشگاه آزاد اسلامی، آستارا، ایران.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Abdollahi-Arpanahi, R., Pakdel, A., Nejati-Javaremi, A. &Shahrbabak, M.M. (۲۰۱۳). Comparison ...
  • Atefi, A. &Shadparvar, A. A. &GhaviHossein-Zadeh, N. (۲۰۱۶). Comparison of ...
  • Bazzi, H., Tahmoorespour, M. & Rokoui, M. (۲۰۱۷). Accuracy of ...
  • Brito, F. V., Neto, J. B., Sargolzaei, M., Cobuci, J. ...
  • Brzustowicz, L. M., Mérette, C., Xie, X., Townsend, L., Gilliam, ...
  • Cheng, K. F. & Chen, J. H. (۲۰۰۷). A simple ...
  • Clark, S. A., Hickey, J. M., Daetwyler, H. D. & ...
  • Daetwyler, H. D., Villanueva, B., Bijma, P. &Woolliams, J. A. ...
  • Daetwyler, H. D., Villanueva, B. &Woolliams, J. A. (۲۰۰۸). Accuracy ...
  • Dekkers, J. C. M. (۲۰۰۷). Prediction of response from markerassisted ...
  • Esfandyari, H., Sorensen, A. C. &Bijma, P. (۲۰۱۵). Maximizing crossbred ...
  • Foroutanifar, S. (۲۰۱۷). Effect of QTL Number and Distribution Effects ...
  • Gowane, G. R., Lee, S. H., Clark, S., Moghaddar, N., ...
  • Habier, D., Fernando, R. L., Kizilkaya, K. & Garrick, D. ...
  • Karimi, K., Sargolzaei, M., Plastow, G. S., Wang, Z. &Miar, ...
  • Latifi, M., Rashidi, A., Abdollahi-Arpanahi, R., Razmkabir, M. (۲۰۲۰). Comparison ...
  • Marquard, V., Beckmann, L., Heid, I.M., Claudia, L. & Chang-Claude, ...
  • Meuwissen, T. H. E., Hayes, B.J. & Goddard, M. E. ...
  • Naderi, Y. (۲۰۱۸). Evaluation of Genomic Prediction Accuracy in Different ...
  • Naderi, S., Yin, T. &König, S. (۲۰۱۶). Random forest estimation ...
  • Nejati-Javaremi, A., Smith, C. & Gibson, J. (۱۹۹۷). Effect of ...
  • Perez, P. & de los Campos, G. (۲۰۱۴). Genome-wide regression ...
  • Pompanon, F., Bonin, A., Bellemain, E. &Taberlet, P. (۲۰۰۵). Genotyping ...
  • Sargolzaei, M. &Schenkel, F. S. (۲۰۰۹). QMSim: a large scale ...
  • Wang, C.L., Ding, X.D., Wang, J.Y., Liu, J.F., Fu, W.X., ...
  • Zhu, W. S., Fung, W. K. &Guo, J. (۲۰۰۷). Incorporating ...
  • نمایش کامل مراجع