بررسی تنوع ژنتیکی بنه های زعفران (Crocus sativus L.) القا شده با پرتو گاما با استفاده از نشانگر SCoT

سال انتشار: 1402
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 63

فایل این مقاله در 20 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JOAGK-15-2_007

تاریخ نمایه سازی: 8 مهر 1402

چکیده مقاله:

هدف: زعفران به دلیل عقیم بودن، صرفا از طریق غیرجنسی تکثیر می یابد و از این جهت، به استثنای برخی جهش های خود به خودی، تغییرات ژنتیکی دیگری، به طور طبیعی در آن ایجاد نمی شود. از این رو، جهش های القایی می توانند به عنوان روشی مناسب جهت ایجاد تنوع در ساختار ژنتیکی گیاه و بهبود خصوصیات رشدی، عملکردی و کیفی آن عمل نمایند. مطالعه حاضر به منظور بررسی تنوع ژنتیکی پرتودیده های گیاه زعفران نسبت به نمونه های شاهد (بدون پرتوتابی) با استفاده از نشانگر SCoT انجام شد. مواد و روش ها: بنه های سالم زعفران در دو سطح ۱۵ و ۱۸ گری پرتو گاما، پرتوتابی و بلافاصله پس از پرتوتابی به همراه بنه شاهد در گلخانه کشت شدند. به منظور بررسی تنوع ژنتیکی ایجاد شده، پس از استخراج DNA از نمونه برگ و تعیین کیفیت و کمیت DNA استخراج شده با استفاده از دستگاه نانودراپ، از ۳۰ آغازگر SCoT استفاده شده، در نهایت ۹ آغازگر برای این بررسی مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. نتایج: در مجموع ۴۷ نوار نمره دهی شد که ۳۳ نوار چندشکلی نشان داد به طوری که بیشترین تعداد نوار چندشکل مربوط به SCoT۰۵ (۶ نوار) و کمترین تعداد مربوط به SCoT۰۴، SCoT۱۱ و SCoT۱۲ (۲ نوار) بود. میانگین درصد و محتوای اطلاعات چندشکلی به ترتیب ۳۵/۶۹ و ۳۶/۰ بدست آمد که بیشترین شاخص محتوای چندشکلی، مربوط به SCoT۱۱ و SCoT۱۷ (۴۵/۰) و کمترین آن مربوط به SCoT۱۳ (۲۳/۰) بود. بیشترین مقدار شاخص نشانگر را نیز SCoT۱۷ (۳۳/۰) به خود اختصاص داد. بر اساس نتایج ماتریس ضرایب تشابه جاکارد، دامنه تغییرات از ۴۵/۰ تا ۸۸/۰ متغییر و میانگین آن برابر با ۷۰/۰ گزارش شد. نتایج تجزیه خوشه ای نیز نشان داد که ۲ نمونه شاهد در خوشه اول، ۳ پرتودیده از ۴ پرتودیده دوز ۱۵ گری در خوشه دوم و به جز پرتودیده ۱۸G۱۰۵ که در خوشه مجزا قرار گرفت، سایر پرتودیده های ۱۸ گری به همراه پرتودیده ۱۵G۱۳۲ از سطح ۱۵ گری در یک خوشه گروه بندی شدند. بیشترین آلل های مشاهده شده (Na) در تیمار ۱۵ گری (۵۵/۱) و کمترین آن در شاهد (۲۷۶۷/۱) برآورد شد. میزان تنوع در جمعیت ۱۵ گری بر اساس شاخص های شانون و نی (۲۰۶۱/۰=I و ۳۰۶۴/۰ =He) بیشتر از شاهد و ۱۸ گری بود. نتیجه گیری: نتایج حاصل از این پژوهش نشان داد نشانگر SCoT۱۷ کارایی بالایی در بروز چندشکلی میان پرتودیده ها و نمونه های شاهد زعفران دارد. تجزیه واریانس مولکولی نیز تنوع درون گروه ها را بیشتر از بین گروه ها ارزیابی نمود. همچنین تفاوت در الگوی نواری نشانگرهای SCoT، الگوی خوشه بندی و یافته های فاصله ژنتیکی، سودمندی پرتودهی گاما و کارایی جهش زایی را برای ایجاد تنوع در گیاه زعفران نشان داد.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

سید ابراهیم سیفتی

استادیار بیوتکنولوژی کشاورزی گروه مدیریت مناطق خشک و بیابانی، دانشکده منابع طبیعی و کویرشناسی، دانشگاه یزد، ایران

علی محمد محیط اردکانی

دانش آموخته کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده منابع طبیعی و کویرشناسی، دانشگاه یزد، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • بهدانی محمدعلی، ایزانلو علی (۱۳۹۸) بررسی تنوع ژنتیکی در زعفران ...
  • سیفتی سید ابراهیم، محیط اردکانی علی محمد، ایزانلو علی، برزویی ...
  • شکرپور مجید، عابدی زینب، کلانتری سیامک، سلامی سید علیرضا (۱۳۹۵) ...
  • محمدی فر آمنه، محمدآبادی، محمدرضا (۱۳۹۰). کاربرد نشانگرهای ریزماهواره برای ...
  • محیط اردکانی علی محمد، سیفتی سید ابراهیم، ایزانلو علی، کریمی ...
  • ReferencesAbdullaev F (۲۰۰۶) Biological properties and medicinal use of saffron ...
  • Alavi-Kia SS, Mohammadi SA, Aharizad S, Moghaddam M (۲۰۰۸) Analysis ...
  • Alavi-Siney SM, Saba J, Nasiri J (۲۰۲۲) Genetic variability and ...
  • Altıntas S, Toklu F, Kafkas S et al. (۲۰۰۸) Estimating ...
  • Babaei S, Talebi M., Bahar M, Zeinali H (۲۰۱۴) Analysis ...
  • Bayat M, Amir Niya R, Taj bakhsh M, Tanyvlach B ...
  • Busconi M, Soffritti G, Stagnati L, et al. (۲۰۱۸) Epigenetic ...
  • Chesnokov YV, Artemyeva AM (۲۰۱۵) Bioinformatics and math statistics. Agric ...
  • Collard BC, Mackill DJ (۲۰۰۹) Start codon targeted (SCoT) polymorphism: ...
  • Dadras AR, Sabouri H, Mohammadi Nezhad Q, et al. (۲۰۱۳) ...
  • Darvasi A, Soller M (۱۹۹۷) A simple method to calculate ...
  • El-Mogy MM, Atia MA, Dhawi F, et al. (۲۰۲۲) Towards ...
  • Gaitán-Espitia JD, Hobday AJ (۲۰۲۱) Evolutionary principles and genetic considerations ...
  • Gautam N, Bhattacharya A (۲۰۲۱) Molecular marker based assessment of ...
  • Gooki FG, Mohammadabadi M, Fozi MA, Soflaei M (۲۰۱۹) Association ...
  • Hong MJ, Kim DY, Jo YD et al. (۲۰۲۲) Biological ...
  • Jahandar Zaboli F, Izanloo A, Ghaderi MG, Rahimi M (۲۰۲۲) ...
  • Jun Z, Xiaobin C, Fang C (۲۰۰۶) The Effects of ...
  • Katiyar P, Pandey N, Keshavkant S (۲۰۲۲) Gamma Radiation: A ...
  • Khan MA, Nagoo S, Naseer S, et al. (۲۰۱۱) Induced ...
  • Khorramdel S, Eskandari Nasrabadi S, Mahmoodi G (۲۰۱۵) Evaluation of ...
  • Kolakar SS, Nadukeri S, Jakkeral SA, et al. (۲۰۱۸) Role ...
  • Leone S, Recinella L, Chiavaroli A, et al (۲۰۱۸) Phytotherapic ...
  • Mallick M, Bharadwaj C, Srivastav M, et al. (۲۰۱۷) Molecular ...
  • Milbourne D, Meyer R, Bradshaw JE, et al. (۱۹۹۷) Comparison ...
  • Mir JI, Ahmad N, Sing DB, et al. (۲۰۱۵) Breeding ...
  • Mohammadifar A, Mohammadabadi MR (۲۰۱۱) Application of Microsatellite Markers for ...
  • Mohit-Ardakani AM, Seifati SE, Izanloo A, Karimi-bekr Z (۲۰۲۲) The ...
  • Ren N, Timko MP (۲۰۰۱) AFLP analysis of genetic polymorphism ...
  • Rubio-Moraga A, Castillo-López R, Gómez-Gómez L, et al. (۲۰۰۹) Saffron ...
  • Sankar V, Dhanarajan A, Gurunathan S, Elangovan D (۲۰۲۲) ۶۰Co ...
  • Seifati SE, Mohit Ardakani AM, Izanloo A, Borzoei A (۲۰۲۱) ...
  • Shaban AS, Arab SA, Basuoni MM, et al. (۲۰۲۲) SCoT, ...
  • Sharaf-Eldin MA, Alam P, Elkholy SF (۲۰۱۹) Molecular and chemical ...
  • Shokrpour M (۲۰۱۹) Saffron (Crocus sativus L.) breeding: opportunities and ...
  • Sivasankar S (۲۰۲۲) New CRP: Radiation-induced Crop Diversity and Genetic ...
  • Smith JSC, Kresovich S, Hopkins MS, et al. (۲۰۰۰) Genetic ...
  • Torricelli R, Yousefi JAVAN, Albertini E, et al. (۲۰۱۹) Morphological ...
  • Tu Anh TT, Khanh TD, Dat TD, Xuan TD (۲۰۱۸) ...
  • نمایش کامل مراجع