بررسی ساختار ژنتیکی جمعیت دهان گرد دریای خزر (Caspiomyzon wagneri Kessler, ۱۸۷۰) در رودخانه شیرود در فصل های بهار و پاییز با روش مولکولی ریزماهواره

سال انتشار: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 36

فایل این مقاله در 18 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JAPB-8-3_003

تاریخ نمایه سازی: 16 اسفند 1402

چکیده مقاله:

در این پژوهش تنوع ژنتیکی دهان گرد دریای خزر در رودخانه شیرود توسط نشانگر ریز ماهواره مورد مطالعه قرار گرفت. برای این منظور، از بافت نرم باله پشتی و دمی ۶۷ قطعه ماهی بالغ از رودخانه شیرود در دو فصل پاییز ۱۳۹۵ و بهار ۱۳۹۶ نمونه برداری شد. استخراج DNA ژنومی به روش استات آمونیوم و واکنش زنجیره ای پلی مراز (PCR) با استفاده از ۱۰ جفت آغازگر صورت گرفت. کمیت و کیفیت DNA با استفاده از روش های اسپکتروفتومتری و الکتروفورز افقی ژل آگاروز ۱ درصد بررسی و رنگ آمیزی با روش نیترات نقره انجام شد. نتایج نشان داد که ۶ جفت از آغازگرها چندشکل و ۴ جفت تک شکل بودند. میانگین کل آلل های واقعی و موثر در ماهیان مولد پاییزه به ترتیب ۶۶/۲ و ۸۸/۱ و در ماهیان مولد بهاره ۱۶/۳ و ۰۶/۲ بود. همچنین هتروزیگوسیتی مشاهده شده و مورد انتظار در ماهیان مولد پاییزه به ترتیب ۱۰۱/۰±۲۳۹/۰ و ۱۱۶/۰±۳۶۳/۰ و در ماهیان مولد بهاره ۱۱۰/۰±۳۷۴/۰ و ۰۹۳/۰±۴۳۴/۰ محاسبه شد. در بررسی تعادل هاردی- واینبرگ (H-W)، بیشتر لوکوس ها خارج از تعادل بودند (۰۵/۰>P). میزان Fst و Rst به دست آمده بر اساس آزمون AMOVA، به ترتیب ۱۵۳/۰ و ۲۰۰/۰ بود که دارای اختلاف معنی داری بود (۰۱/۰>P). نتایج به دست آمده از این پژوهش نشان داد دو جمعیت مجزا از لحاظ ژنتیکی در رودخانه شیرود وجود دارد که در باسازی ذخایر آن باید توجه لازم را به کار گرفت.

نویسندگان

حامد مفتاح

دکتری زیست شناسی دریا، گروه زیست شناسی دریا، دانشکده علوم دریایی و اقیانوسی، دانشگاه علوم و فنون دریایی خرمشهر، خرمشهر، ایران

محمد علی سالاری علی آبادی

دانشیار گروه زیست شناسی دریا، دانشکده علوم دریایی و اقیانوسی، دانشگاه علوم و فنون دریایی خرمشهر، خرمشهر، ایران

رحیم عبدی

دانشیار گروه زیست شناسی دریا، دانشکده علوم دریایی و اقیانوسی، دانشگاه علوم و فنون دریایی خرمشهر، خرمشهر، ایران

محمد پورکاظمی

استاد موسسه تحقیقات علوم شیلاتی کشور، تهران، ایران

ایوب فرهادی

دانشیار گروه علوم دامی، دانشکده علوم دامی و شیلات، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ساری، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Abdoli A., Farokhnejad M.R., Nazari H. and Kiabi B. ۲۰۱۷. ...
  • Adams B. and Hutchings J.A. ۲۰۰۳. Microgeographic population structure of ...
  • Ahmadi M., Amiri B.M., Abdoli A., Fakharzade S.M.E. and Hoseinifar ...
  • Balloux F. and Lugon‐Moulin N. ۲۰۰۲. The estimation of population ...
  • Bassam B.J., Caetano-Anolles G. and Gressshoff P.M. ۱۹۹۱. Fast and ...
  • Beamish R.J. ۱۹۸۰. Adult biology of the river lamprey (Lampetra ...
  • Beamish R.J. and Withler R.E. ۱۹۸۶. A polymorphic population of ...
  • Coad B.W. ۲۰۱۶. Review of the Lampreys of Iran (Family ...
  • Dewoody J. and Avise J. ۲۰۰۰. Microsatellite variation in marine, ...
  • Dorak M.T. ۲۰۰۵. Basic population genetics. Retrieved April ۱۸, ۲۰۱۴, ...
  • Gaigher A., Launey S., Lasen E., Besnard A.L. and Evanno ...
  • Garcia De Leon F.J., Chikhi L. and Bonhomme F. ۱۹۹۷. ...
  • Gess R.W., Coates M.I. and Rubidge B.S. ۲۰۰۶. A lamprey ...
  • Hallerman E.M. ۲۰۰۳. Population Genetics: Principles and Applications for Fisheries ...
  • Hilborn R., Francis R.C. and Rogerse D.E. ۲۰۰۶. Marine and ...
  • Holcik J. ۱۹۸۶. The Freshwater Fishes of Europe, Vol. ۱, ...
  • Holcik J. and Olah J. ۱۹۹۲. Fish, fisheries and water ...
  • http://www.fao.org/۳/AD۱۹۲E/AD۱۹۲E۰۰.htmImanpoor M.R. and Abdollahi M. ۲۰۱۱. Serum biochemical parameters of ...
  • Ivanov V.P. and Velasenko A.D. ۲۰۰۱. The relict fish of ...
  • Kelso J. and Gardner W. ۲۰۰۰. Emigration, upstream movement, and ...
  • Kiabi B.H., Abdoli A. and Naderi M. ۱۹۹۹. Status of ...
  • Kuszewski J. and Witkowski A. ۱۹۹۵. Morphometrics of the autumn ...
  • Lazar I. and Lazar I. ۲۰۱۷. Gel Analyzer ۲۰۱۰a: Freeware ...
  • Lin B., Zhang Z., Wang Y., Kenneth P., Yamazaki Y. ...
  • Lu C. ۱۹۹۸. Diversity of Cephalopoda from the waters around ...
  • Maitland P.S., Morris K.H. and Est K. ۱۹۹۴. The ecology ...
  • Matthaeis E.D., Davolos D., Cobolli M. and Ketmaier V. ۲۰۰۰. ...
  • McFarlane C.T. and Docker M.F. ۲۰۰۹. Characterization of ۱۴ microsatellite ...
  • McQuown E.C., Sloss B.L., Sheehan R.J., Rodzen J., Tranah G. ...
  • Moser M.L., Matter A.L., Stuehrenberg L.C. and Bjornn T.C. ۲۰۰۲. ...
  • Nazari H. and Abdoli A. ۲۰۱۰. Some reproductive characteristics of ...
  • Nazari H., Abdoli A., Kiabi B. and Coad B. ۲۰۱۷. ...
  • Nei M. ۱۹۷۸. Estimation of average heterozygosity and genetic distance ...
  • Peakall R. and Smouse P.E. ۲۰۰۶. GENALEX ۶: Genetic analysis ...
  • Quintella B., Andrade N., Koed A. and Almedia P.R. ۲۰۰۴. ...
  • Reisenbichler R. and Rubin S. ۱۹۹۹. Genetic changes from artificial ...
  • Rezvani Gilkolaei S. ۱۹۹۷. Molecular population genetic studies of sturgeon ...
  • Ryman N. ۱۹۹۱. Conservation genetics considerations in fishery management. Journal ...
  • Sambrook J. and Russell D.W. ۲۰۰۶. Isolation of high-molecular-weight DNA ...
  • Schedina I.M., Pfautsch S., Hartmann S., Dolgener N., Polgar A., ...
  • Shaklee J.B., Tamaru C.S. and Waples R.S. ۱۹۸۲. Speciation and ...
  • Takeshima H., Yokoyama R., Nishida M. and Yamazaka Y. ۲۰۰۵. ...
  • Thorpe J.P. and Sol-Cave A.M. ۱۹۹۴. The use of allozyme ...
  • Waples R.S., Teel D.J., Myers J.M. and Marshall A.R. ۲۰۰۴. ...
  • نمایش کامل مراجع