آنالیز فیلوژنی مولکولی اعضای قبیله Eritrichieae از خانواده گاوزبان بر اساس توالی کلروپلاستی psbA- trnH
محل انتشار: چهارمین همایش بیوانفورماتیک ایران
سال انتشار: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 900
نسخه کامل این مقاله ارائه نشده است و در دسترس نمی باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
IBIS04_027
تاریخ نمایه سازی: 14 شهریور 1393
چکیده مقاله:
قبیله Eritrichieae متعلق به خانواده گاوزبان بوده و دارای 62 گونه در ایران می باشد. در تحقیق حاضر از توالی نوکلئوتیدیtrnH- psbA جهت تعیین موقعیت تاکسونومیکی این قبیله استفاده گردید. از مزایای توالی مذکوراین است که از نمونه هایهرباریومی با محتوای ژنومی خرد شده به راحتی قابل تکثیر است و به دلیل نرخ بالای جانشینی به عنوان اولین توالی برایDNA نشانگرمطرح شده است. در این پژوهش ابتدا DNA کل از برگ نمونه های گیاهی استخراج شده و سپس قطعه ی ژنیpsbA- trnH با استفاده از دستگاه ترموسیکلر تکثیر شد. پس از چک کردن کمیت و کیفیت قطعه با الکتروفورز، محصولاتPCR جهت توالی یابی فرستاده خواهند شد. سپس هم ردیف سازی توالی های انجام شده با برنامه MUSCLE یا Clustal X انجام گرفته و به دنبال آن جهت نشان دادن قرابت گونه ها ،آنالیز فیلوژنی با نرم افزار های نظیر RAxML ،MrBayes ، PAUP انجام گرفت. نتایج نشان داد قبیله مذکور تک تبار نمی باشد. گونهAsperugo procumbens در قاعده درخت قرار می گیرد، دو جنس Heterocaryum و Rochelia تک تبارند ولی جنس های Lappula و Lepechiniella تک تبار نیستند. گونه های جنس Lepechiniella توالی های نوکلئوتیدی مشابه با Lappula microcarpa وL. barbata نشان دادند
کلیدواژه ها:
نویسندگان
مریم خوش سخن مظفر
دانشگاه آزاد اسلامی واحد قم، گروه زیست شناسی، قم، ایران
شاهرخ کاظم پور او صالو
دانشگاه تربیت مدرس، دانشکده علوم زیستی، گروه علوم گیاهی، تهران، ایران
عاطفه امیر احمدی
دانشگاه تربیت مدرس، دانشکده علوم زیستی، گروه علوم گیاهی، تهران، ایران
رقیه اسکوئیان
گروه زیست شناسی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد آیت الله آملی، آمل