مروری بر تطبیق دنباله های زیستی با استفاده از FPGA

سال انتشار: 1395
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 541

فایل این مقاله در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

COMCONF02_181

تاریخ نمایه سازی: 5 بهمن 1395

چکیده مقاله:

هدق از تطیبیق دنیاله های زیستی، پیدا کردن نواحی شیبیه یه هم در دنیاله ها می یاشد که ممکن است ساختار تکاملی مشترک و یا یک ناحیه عملیاتی یکسانی داشته یاشند. دنیاله های زیستی شامل DNA پروتئین و RNA می باشند. یا استفاده از تطبیق دنیاله های زیستی می توان یه وجود بیماری، کشف دارو و بهینه سازی دارو پی یرد. سرعت و دقت یرای مسئله تطبیق دنیاله های زیستی یسیار مهم می یاشد. روش های ترم اقزاری یرای تطیبیق دنیاله های زیستی دارای سرعت پایین می یاشند و دقت جوابی نرم اقزارها 100 درصد نمی یاشد و درصدی از تقریبی می یاشد. استغاده از قطعه FPGA یاعت می شود که سرعت تطییق دنیاله های زیستی اقزایش چشمگیری داشته یاشد و همچنین دقت آن 100 درصد می یاشد. در این پژوهشی، مروری یر کارهای انجام شده یرای مسئله تطیبیق دنیاله های زیستی یا استغاده از FPGA انجام داده ایم. پژوهش انجام شده شامل یررسی مزایا و معایی پیاده سازی انواع الگوریتم ها و سخت اقزارهای طراحی شده یرای مسئله تطیبیق دنیاله های زیستی یا استفاده از FPGA می یاشد.

نویسندگان

علی قربانی نقاب

دانشگاه آزاد اسلامی، واحد بجنورد ، گروه برق ، بجنورد ، ایران

رضا شیعبی

دانشگاه آزاد اسلامی، واحد کناباد، باشگاه پژوهشگران جوان و نخبگان، گناباد ، ایران

افشین شعیبی عمرانی

دانشگاه آزاد اسلامی، واحد بجنورد ، گروه برق ، بجنورد ، ایران

سمیه فیضی

دانشگاه آزاد اسلامی، واحد بجنورد ، گروه برق ، بجنورد ، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • methods in bioinformatic, an Statisticalه 5.Ewens, Warren, J. and Gregory ...
  • Hogewe, P. and Searls. and David, B. ed. (2011), ;"The ...
  • Theoretical Biology, " 2011 PLSCB. ..7E0020H. ...
  • Hesper, B. and Hogeweg, P. (1970), _ 'Bioinformatc a: _ ...
  • Hogeweg, P. (1978), :Simulating the growth of cellular forms, Simulation ...
  • Durbin, R. and Eddy, S. and Krogh, A. and Mitchison, ...
  • "ENCODE. Encyclopaedia Britannica Online. Encyclopdaeia Britannica Inc. Retrieved May 9, ...
  • Aston, KI. (20 14), ;Genetic susceptibility to male infertility: News ...
  • Veron, A. and Blein, S. Cox, D. G. (20 14), ...
  • Tosto, G. and Reitz, C. (2013), "Genome-wide association studies in ...
  • Hye-Jung, E. C. and Jaswinder, K. and Martin, K. and ...
  • Tortora, G. J. and Derrickson, B. H. (2011), :Principles of ...
  • Kharagpur, "Field Programmable Gate Arrays and Applications, " Version 2 ...
  • Laiq H. and Zaid A. (2011), ;An Overview of Hardware-B ...
  • Server, K. and Khaled, B. and Ying, L. (2008), ;"High ...
  • James, A. and Kuen, H. T. (2013), ;"Wayne Luk and ...
  • Edgar, J. G. and Neto, S. and Nadia, N. and ...
  • Xinyu, G. and Hong, W. and Vijay, D. (2012);A Systolic ...
  • Khaled, B. and Ying, L. and AbdSamad, B. (2009), ;:A ...
  • Tomas, M. (20 10), "Evaluation of Biological Sequence Similarity Using ...
  • David, G. and Sutirtha, S. and Satnam, S. (2009), "Synthesis ...
  • Agathoklis, P. and Ioannis, K. and Vasilis, J. P. and ...
  • Saad, Kh. Z. and Laiq, H. and Asif, A. Kh. ...
  • Yupeng, C. and Bertil, S. and Douglas, L. M. (2013), ...
  • Al Junid, S. A. M. and Haron, M. A. and ...
  • Xianyang, J. and Xinchun, L. and Lin, X. and Peiheng, ...
  • Parag, K. L. (2015), ;:A CAM (Content Addressable Memory) Architecture ...
  • Rahul, P. M. and et al. (2006), "Accelerator Design for ...
  • نمایش کامل مراجع