بررسی روش های تجزیه و تحلیل اطلاعات microRNA ها با استفاد استفاده از تکنیک های یادگیری ماشین

سال انتشار: 1395
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 593

فایل این مقاله در 7 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

AISST02_028

تاریخ نمایه سازی: 6 اردیبهشت 1396

چکیده مقاله:

اmicroRNA ها مولکولهای RNA رمزگذاری نشدهی کوچکی هستند که توانایی اتصال به ژن RNAپیام رسان هدف را دارند. وجود تکنیک های علمی و آزمایشگاهی برای شناسایی و پیش بینی ژنهای هدف، محدودیتهای مهمی ازجمله پوشش کم، آزمایشات زمانبر و مواد آزمایشگاهی پرهزینه را در بردارد. از این رو، روشهای محاسباتی زیادی برای این امر به منظور غلبه بر این محدودیت ها پیشنهاد شده اند. اخیرا، محققان زیادی بر روی بست دادن روش های محاسباتی به منظور حضور ژن های microRNA در شبکه های قاعده مند و تجزیه و تحلیل مکانیزم رونویسی آنها، تاکید داشته اند. تمام این روش ها و دیدگاه ها به طور قطع دارای امتیازات و اشکالاتی هستند که در این مقاله به توضیح و تشریح آنها پرداخته خواهد شد. تلاش ما در این مقاله متمایز ساختن این تحقیق از بررسی ها و مقالات موجود است که این امر به وسیله ی به روز کردن انواع روش ها و متدها صورت می پذیرد و تاکید این تحقیق بر روی نتیجه ی محاسباتی است که از تجزیه و تحلیل اطلاعات microRNA به دست می آیند. همچنین در این مقاله، مراحل تجزیه و تحلیل اطلاعات microRNAهای مختلف به صورت یک روند یکپارچه معرفی می شوند که هدف و طرح نهایی آنها، پی بردن به نقش تنظیمی و مکانیزم های ژنهای microRNA است. در این مقاله تمرکز بر روی معرف روش هایی است که از تکنیک های یادگیری ماشین و روش های الگوریتمی برای تجزیه و تحلیل اطلاعات microRNAهای مختلف استفاده می کنند. این دیدگاه پیوسته از مراحل تجزیه و تحلیل اطلاعات microRNA ،حتی برای کسانی که فقط قصد مطالعه بر روی یکی از این مراحل را دارند نیز میتواند بسیار سودمند باشد.

کلیدواژه ها:

microRNA ، تجزیه و تحلیل اطلاعات مولکولی ، پیش بینی ژنهای هدف ، تکنیک های یادگیری ماشین

نویسندگان

فهیمه نژادعلی نایی

گروه، مهندسی کامپیوتر ، واحد علوم و تحقیقات خراسان رضوی نیشابور ، دانشگاه آزاد اسلامی ، نیشابور ، ایران

رضا قائمی

گروه، مهندسی کامپیوتر ، واحد قوچان ، دانشگاه آزاد اسلامی ، قوچان ، ایران

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Kozomara A Griffiths-Jones S, "miRBase: anotating high confidence microRNAs using ...
  • Zhou J, Cheng Y , et al , "Identificatio of ...
  • MicroRNA Target Prediction, Genes 2014, 5, 671-683; ...
  • Lin C, Jiang W, Mitra R, Cheng F, "Regulation rewiring ...
  • Kandeel M, Nakashima R, Sakaguchi T, et al, "Bioenergetics and ...
  • _ Herranz H, Cohen S. MicroRNAs and gene regulatory networks: ...
  • ]7[Dong, Q.H., et al. Computational identification of MicroRNAs in strawberry ...
  • _ T. C. Roberts, _ microRNA biology of the mammalian ...
  • _ S. L. Ro mero-Cordoba, I. S al i do- ...
  • chemi cally-:induced B ioinformatics, 2015. ...
  • ]11[Li L, Xu J, Yang D, et al. Computational approaches ...
  • ]12[J. Hertel, D. Langenberger, and P. F. Stadler, omputational prediction ...
  • ]14[Sewer A, Paul N, Landgraf P, et al. Identification of ...
  • ]15[Szafranski K, Megraw M, Reczko M, Hatzigeorgiou AG. Support vector ...
  • Seyeddokht A _ Aslaminejad A, Computational Detection of piRNA in ...
  • ]17[Ng KLS, Mishra SK. De novo SVM classification _ precursor ...
  • ]18[Batuwita R, Palade V. MicroPred: effective classification of pre-miRNAs for ...
  • ]19[Veropoulos K, Cristianini N, Campbell C. The application of support ...
  • ]21[Huang TH, Fan B, Rothschild MF, et al. MiRFinder: an ...
  • ]21[Theofilatos K, Kleftogiannis D, Rapsomaniki M, et al. A novel ...
  • ]22[Xuan P, Guo M, Liu X, et al. P _ ...
  • ew A"و]23[Oulas A, Karathanasis N, Louloupi A, I microRNA target ...
  • ]24[Saito T, Saetrom P. MicroRNAs targeting and target prediction. New ...
  • ]25[Campo S, Pens-Pens C., Sire C "Identification of a novel ...
  • ]27[Gaidatzis D, van Nimwegen E, Hausser J, et al. Inference ...
  • ]28[Hausser J, Berninger P, Rodak C, et al. MirZ: an ...
  • ]29[Huang JC, Babak T, Corson TW, et al. Using expression ...
  • Acids Res, vol. 41, no. 8, pp. 4392-408, 2013. ...
  • ]31[Diehl P., Fricke A. Sander, "Microparticles : major e23932, 2013. ...
  • circulation", Cardiovasc Res, vol. 93, no. 4, pp. 633-44, 2012. ...
  • نمایش کامل مراجع