کشف و شناسایی مولکولی قارچ های سیاه به عنوان عامل میکروبی در جنگ نوین

قارچ های سیاه به صورت گندروی بر روی مواد گیاهی زنده یا مرده ساکن هستند اما بیشتر آن ها ساکن خاک می باشند. بیش از 70 جنس و 150 گونه از قارچ های سیاه در بیماری های انسان و حیوان دخالت دارند . قارچ های سیاه در نابودی و فساد فرآورده های کشاورزی نقش دارند . فیوهایفومایکوزیس به بیماری های ایجاد شده توسط قارچ های تیره ازجنس های مختلف اطلاق می شود. روش های استاندارد و رایج برای تشخیص درقارچ شناسی شامل: روش های فنوتایپی و مولکولی می باشد.روش های فنوتایپی شامل روش های مورفولوژیکی (مانندآزمایش میکروسکوپی مستقیم، رنگ آمیزی های مختلف،کشت در محیط های کشت انتخابی و اختصاصی،تست لوله زایاوغیره) و روش های فیزیولوژیکی(مانند رشد یا عدم رشد در محیط کشت حاوی سیکلوهگزامید، جذب و تخمیرقندها، نیترات ها، ترکیبات آروماتیک، فعالیت اوره آز، مقاومت به نمک، حرارت و غیره)می باشد. روش های مولکولی شامل روش هایی مبتنی برواکنش زنجیره پلی مرازی وروش های غیر مبتنی بر واکنش زنجیره پلی مرازی از جمله تعیین توالی ژن های ریبوزومی و مقایسه آنها با پایگاه داده های منتشر شده در بانک ژنی می باشد. دقت روش های فنوتایپی در شناسایی تا حد جنس، و زمان بر است؛ اما دقت روش های مولکولی تا حد گونه و در زمان اندک می باشد. این تحقیق بعد از جمع آوری نمونه ها و تهیه کشت خالص ابتدا با استفاده از روش های مورفولوژیکی اقدام به شناسایی در حد جنس نموده است .مرحله بعد ژنوم نمونه ها استخراج و صحت آن با الکتروفورز تایید گردید.سپس با انجام روش های مولکولی مبتنی بر واکنش زنجیره ای پلی مرازی ژنوم تکثیر و صحت آن با الکتروفورز تایید گردید ، در نهایت با روش های غیرمبتنی بر واکنش زنجیره ای پلی مرازی توالی یابی و انجام روش بیوانفورماتیکی (تطابق با توالی های مرجع) شناسایی و آشکارسازی در حد گونه و واریته، برای 15 نمونه از قارچ های سیاه انجام شد.