کاربرد بیومارکرهای لیپیدی برای ارزیابی ساختار جمعیت میکروبی خاک
محل انتشار: فصلنامه بیوتکنولوژی کشاورزی، دوره: 7، شماره: 2
سال انتشار: 1394
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 439
فایل این مقاله در 26 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JOAGK-7-2_002
تاریخ نمایه سازی: 20 خرداد 1398
چکیده مقاله:
تعادل اکولوژیک جوامع میکروبی خاک، با توجه به نقش حیاتی و محوری آنها به عنوان شاخص سلامت اکوسیستم خاک، از اهمیت بالایی برخوردار میباشد. بهره گیری از روش های مختلف برای دستیابی به وضعیت جامعه میکروبی خاک وجود دارد. روشهای کشت میکروبی برای این منظور مناسب نیستند، زیرا قسمت اعظم ریزجانداران قادر به رشد در محیط کشت نمیباشند. روشهای مولکولی و تکنیکهای بر پایه DNA فقط تنوع میکروبی را میدهند. پس یک روش سریع برای ارزیابی ساختار جامعه میکروبی در خاک استفاده از الگو اسید چرب فسفولیپیدی (PLFA) میباشد (زیرا بعد از مرگ سلول به سرعت توسط فعالیت آنزیم فسفاتاز تجزیه میشود). بهعلاوه PLFA میتواند اطلاعات وسیع از تنوع، زیستتوده و وضعیت تغذیهای– فیزیولوژیک آنها فراهم آورد. PLFAهای مخصوص و معینی مثل نسبت اسید چرب فسفولیپید با موقعیت (ترانس) 16:1ω7t به اسید چرب فسفولیپید با موقعیت (سیس) 16:1ω7c (trance/cis)، نسبت مجموع اسیدهای چرب فسفولیپیدی سیکلوپروپیل (cy17:0 و cy19:0) به مجموع اسیدهای چرب فسفولیپیدی با یک پیوند دوگانه پیشگام 16:1ω7و 18:1ω7) (cy/pre)، نسبت اسیدهای چرب فسفولیپیدی اشباعشده به غیراشباع با یک پیوند دوگانه (S/M)، نسبت اسیدهای چرب فسفولیپیدی باکتریهای گرم منفی به اسیدهای چرب باکتریهای گرم مثبت (G-/G+) و نسبت اسید چرب فسفولیپیدی قارچهای ساپروفیت (18:2ω6,9) به اسیدهای چرب نشانگر باکتریها (F/B)، قادرند به عنوان شاخصهای وضعیت فیزیولوژیکی یا تغذیه در شرایط مختلف محیطی همچون خاکهای آلودهشده به فلزات سنگین، تغییرات pH، تغییرات عمق، خشکی، شوری، مدیریتهای مختلف کشاورزی و شرایط غرقابی، برای ارزیابی جوامع میکروبی خاک به کار میروند. روش تجزیه PLFA در خاک و تعیین زیستتوده، تنوع میکروبی و وضعیت فیزیولوژیک در اینجا بررسی میشود
کلیدواژه ها:
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :