کاربرد بیومارکرهای لیپیدی برای ارزیابی ساختار جمعیت میکروبی خاک

سال انتشار: 1394
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 439

فایل این مقاله در 26 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JOAGK-7-2_002

تاریخ نمایه سازی: 20 خرداد 1398

چکیده مقاله:

تعادل اکولوژیک جوامع میکروبی خاک، با توجه به نقش حیاتی و محوری آن­ها به عنوان شاخص سلامت اکوسیستم خاک، از اهمیت بالایی برخوردار می­باشد. بهره گیری از روش های مختلف برای دستیابی به وضعیت جامعه میکروبی خاک وجود دارد. روش­های کشت میکروبی برای این منظور مناسب نیستند، زیرا قسمت اعظم ریزجانداران قادر به رشد در محیط کشت نمی­باشند. روش­های مولکولی و تکنیک­های بر پایه DNA فقط تنوع میکروبی را می­دهند. پس یک روش سریع برای ارزیابی ساختار جامعه میکروبی در خاک استفاده از الگو اسید چرب فسفولیپیدی (PLFA) می­باشد (زیرا بعد از مرگ سلول به سرعت توسط فعالیت آنزیم فسفاتاز تجزیه می­شود). به­علاوه PLFA می­تواند اطلاعات وسیع از تنوع، زیست­توده و وضعیت تغذیه­ای– فیزیولوژیک آن­ها فراهم آورد. PLFAهای مخصوص و معینی مثل نسبت اسید چرب فسفولیپید با موقعیت (ترانس) 16:1ω7t به اسید چرب فسفولیپید با موقعیت (سیس) 16:1ω7c (trance/cis)، نسبت مجموع اسیدهای چرب فسفولیپیدی سیکلوپروپیل (cy17:0 و cy19:0) به مجموع اسیدهای چرب فسفولیپیدی با یک پیوند دوگانه پیشگام  16:1ω7و 18:1ω7) (cy/pre)، نسبت اسیدهای چرب فسفولیپیدی اشباع­شده به غیراشباع با یک پیوند دوگانه (S/M)، نسبت اسیدهای چرب فسفولیپیدی باکتری­های گرم منفی به اسیدهای چرب باکتری­های گرم مثبت (G-/G+) و نسبت اسید چرب فسفولیپیدی قارچ­های ساپروفیت (18:2ω6,9) به اسیدهای چرب نشانگر باکتری­ها (F/B)، قادرند به عنوان شاخص­های وضعیت فیزیولوژیکی یا تغذیه در شرایط مختلف محیطی همچون خاک­های آلوده­شده به فلزات سنگین، تغییرات pH،  تغییرات عمق، خشکی، شوری، مدیریت­های مختلف کشاورزی و شرایط غرقابی، برای ارزیابی جوامع میکروبی خاک به کار می­روند. روش تجزیه PLFA در خاک و تعیین زیست­توده، تنوع میکروبی و وضعیت فیزیولوژیک در اینجا بررسی می­شود

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Aliasgharzad N, Molaei A, Oustan S (2011). Pollution induced community ...
  • Aliasgharzad N, Saleh Rastin N, Towfighi H, Alizadeh A (2001). ...
  • Aliasgharzad N, Hajiboland  R, Olsson PA (2011). Lack of arbuscular ...
  • Aliasgharzad N, Mårtensson LM, Olsson PA (2010). Acidification of a ...
  • Allison VJ, Miller RM, Jastrow J D, Matamala R, Zak ...
  • Aslani Z, Hassani A, Rasouli-Sadaghiani MH, Sefidkon F, Barin M ...
  • Aslani Z, Hassani A, Rasouli-Sadaghiani MH, Sefidkon F, Barin M, ...
  • Baath E, Diaz-Ravina M, Frostegard A, Campbell CD (1998). Effect ...
  • Barin M, Rasouli Sadaghiani MH, RezaeiDanesh Y (2010). The effect ...
  • Barin M, Aliasgharzad N, Olsson PA, Moghaddam M, Rasoli-Sadaghiani MH ...
  • Barin M, Aliasgharzad N, Olsson PA, Moghaddam M, Rasoli-Sadaghiani MH ...
  • Barin M, Aliasgharzad N, Olsson PA, Moghaddam M, Rasoli-Sadaghiani MH ...
  • Barin M, Aliasgharzad N, Rasoli-Sadaghiani MH, Mohayegi M, Pouryosof H, ...
  • Barin M, Aliasgharzad N, Rasoli-Sadaghiani MH, Mohayegi M, Pouryosof H, ...
  • Barin M, Aliasgharzad N, Samadi A (2006a). Effects of NaCl-induced ...
  • Barin M, Aliasgharzad N, Samadi A (2006b). Influece of mycorrhization ...
  • Barin M, Aliasgharzadeh N, Samadi A, Rasouli Sadaghiani MH (2008). ...
  • Bing-Ru L, Guo-Mei J, Jian C, Gang W (2006). A ...
  • Boschker HTS, Middelburg JJ (2002). Stable isotopes and biomarkers in ...
  • Bossio DA, Scow KM (1998). Impacts of carbon and flooding ...
  • Cardon ZG, Gage DJ (2006). Resource exchange in the rhizosphere: ...
  • Carney KM, Matson PA (2005). Plant communities, soil microorganisms, and ...
  • Córdova-Kreylos AL, Cao Y, Green PG, Hwang HM, Kuivila KM, ...
  • Cordovilla MDP, Ligero F, Lluch C (1999). Effect of  salinity ...
  • DeGrood SH, Classens VP, Scow KM (2004). Microbial community composition ...
  • Denich TJ, Beaudette LA, Lee H, Trevors JT (2003). Effect ...
  • Edlund A, Nichols PD, Roffey R, White DC (1985). Extractable ...
  • Evgrafova SY, Santruckova H, Shibistova OB, Elhottova D, Cerna B, ...
  • Fierer N, Schimel JP, Holden PA (2003). Variations in microbial ...
  • Frostegard A, Baath E, Tunlid A (1993). Shifts in the ...
  • Frostegård Å, Tunlid A, Bååth E (2011). Use and misuse ...
  • Frostegård A, Bååth E (1996). The use of phospholipid fatty ...
  • Frostegård Å, Tunlid A, Bååth E (1993). Phospholipid fatty acid ...
  • Frostegård Å, Tunlid A, Bååth E (1991). Microbial biomass measured ...
  • Gelsomino A, Keijzer-Wolters AC, Cacco G, van Elsas JD (1999). ...
  • Green CT, Scow KM (2000). Analysis of phospholipid fatty acids ...
  • Grifiths BS, Heckmann LH, Caul S, Thompson J, Scimgeor C, ...
  • Guckert JB, Hood MA, White DC (1986). Phospholipids esterlinked fatty ...
  • Hajiboland R, Aliasgharzad N, Mehrfar Z (2004). Ecological study of ...
  • Hedlund K (2002). Soil microbial community structure in relation to ...
  • Hill GT, Mitkowski NA, Aldrich-Wolfe L, Emelea LR, Jurkonie DD, ...
  • Hoyle F, Murphy D, Brookes P (2008). Microbial response to ...
  • Kaiser C, Frank A, Wild B, Koranda M, RichterA (2010). ...
  • Kang S (2005). Spatial structures of soil microbial communities and ...
  • Kaur A, Chaudhary A, Kaur A, Choudhary R, Kaushik R ...
  • Kazemalilou S, Rasouli Sadaghiani, MH, Khodaverdiloo, H. Barin M (2013). ...
  • Kelly JJ, HaÈggblom M, Tate RL. (1999). Changes in soil ...
  • Kerger B, Nichols PD, Antwortht CP, Sand W, Bock E, ...
  • Kieft TL, Wilch E, Oconnor K, Ringelberg DB, White DC ...
  • Kirk JL, Beaudette LA, Hart M, Moutoglis P, Klironomoms JN, ...
  • Kucera JM, Dick RP (2008). PLFA profling of microbial community ...
  • Langer U, Rinklebe J (2009). Lipid biomarkers for assessment of ...
  • Molaei A, Aliasgharzad N, Oustan S ( 2012). Effect of ...
  • Mubyana-John T, Wutor VC, Yeboah SO, Ringrose S (2007). Fire ...
  • Olsson PA, Rahm J, Aliasgharzad N (2010). Carbon dynamics in ...
  • Olsson PA (1999).Signature fatty acids provide tools for determination of ...
  • Oren A (1999). Bioenergetic aspects of halophilism. Microbiology and Molecular. ...
  • Pennanen T, Frostegård Å, Fritze H, Bååth E (1996). Phospholipid ...
  • Piotrowska-Seget Z, Mrozik A (2003). Signature Lipid Biomarker (SLB) Analysis ...
  • Poormazaheri H, Salehi Jouzani Gh, Khayam nekoui SM, Tabatabaei M, ...
  • Powlson DS, Brookes PC, Christensen BT (1987). Measurement of soil ...
  • Rahmanian M, Khodaverdiloo H, Rasouli Sadaghiani MH, Rezaee Danesh Y ...
  • Rahmanian M, Rezaee Danesh Y, Khodaverdiloo H, Rasouli Sadaghiani MH, ...
  • Ramsey PW, Rillig MC, Feris KP, Holben WE, Gannon JE ...
  • Rasouli-Sadaghiani MH, Hassani A, Barin M, Rezaee Danesh Y, Sefidkon ...
  • Russell NJ (1995). Psychrotrophy and adaptation to low temperatures:microbial membrane ...
  • Saleh-Rastin N, (2005). Sustainable management from the soil biological perspective. ...
  • Sarikhani MR, Malboobi MA, Ebrahimi M (2014).  Phosphate solubilizing bacteria: ...
  • Shahbazi F, Aliasgharzad N, Ebrahimzad SA, Najafi N (2013). Geostatistical ...
  • Steenwertha KL, Jacksona LE, Calderon FJ, Stromberg MR Scow KM ...
  • Velasco AG, Probanza A, Mañero FJG, Solano BR Lucas JA ...
  • Wardle DA, Bardgett RD, Klironomos JN (2004). Ecological linkages between ...
  • Wichern J, Wichern F, Joergensen Rg (2006). Impact of salinity ...
  • Zahran HH (1997). Diversity, adaptation and activity of the bacterial  ...
  • Zak DR, Holmes WE, White DC (2003). Plant diversity, soil ...
  • Zelles L (1999). Fatty acid patterns of phospholipids and lipopoly-saccharides ...
  • Zornoza R, Guerrero C, Mataix-Solera J, Scow KM, Arcenegui V, ...
  • نمایش کامل مراجع